RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 AWAT2Q6E213 333 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 GID4Q8IVV7 300 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 NRMQ8IXM6 262 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 OR51A7Q8NH64 312 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 LIPHQ8WWY8 451 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM203Q969S6 136 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 RASD2Q96D21 266 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 C14orf144Q96I85 54 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 Q96M85 177 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 IL19Q9UHD0 177 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.41□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 GGT3PA6NGU5 568 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 UNC119BA6NIH7 251 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 H3BN98 237 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 J3KTA2 159 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 MFNGO00587 321 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 CDC42EP2O14613 210 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 RER1O15258 196 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 TCAPO15273 167 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 CHRM2P08172 466 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 HOXB5P09067 269 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF44P15621 663 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 HLA-GP17693 338 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 HOXA5P20719 270 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 TNFSF4P23510 183 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 CRABP1P29762 137 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 HTR1FP30939 366 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 NHLH2Q02577 135 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 RHEBQ15382 184 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 MEP1BQ16820 701 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF546Q86UE3 836 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 IL17DQ8TAD2 202 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 HAVCR1Q96D42 359 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 TECTBQ96PL2 329 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 OR8B2Q96RD0 313 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 TMED9Q9BVK6 235 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 SIRPDQ9H106 197 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 SYT4Q9H2B2 425 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 RAB18Q9NP72 206 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 MED31Q9Y3C7 131 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 ETV7Q9Y603 341 aa6.4□□□□□ -1.38
SZRD1-208ENST00000476423 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 M0QZK8 103 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 FFAR1O14842 300 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 TOX4O94842 621 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 SIX6O95475 246 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 IGF2P01344 180 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 IGHV1-69P01742 117 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 COX5BP10606 129 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 CELP19835 753 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 NOS3P29474 1203 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 DDTP30046 118 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 CAV2P51636 162 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 CCR6P51684 374 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 PCBD1P61457 104 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 HAGHQ16775 308 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 ARL9Q6T311 187 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.39□□□□□ -1.39
SZRD1-208ENST00000476423 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms