RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 IFNL4K9M1U5 179 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 NKX2-8O15522 239 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 MLNRO43193 412 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 NUPR1O60356 82 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 FOXH1O75593 365 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 SERF1AO75920 110 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 KRASP01116 189 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF28P17035 718 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 NPY1RP25929 384 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 FCRL6Q6DN72 434 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 Q6ZSR6 202 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 Q8N976 141 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PPTC7Q8NI37 304 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 FNDC9Q8TBE3 224 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC00597Q9H2U6 94 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TXNIPQ9H3M7 391 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 LHX3Q9UBR4 397 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 SCN8AQ9UQD0 1980 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC88CQ9P219 2028 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TRIOO75962 3097 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 MYLKQ15746 1914 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM231BA6NCW3 169 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 RIIAD1A6NNX1 92 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 H3BMH7 237 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 KIR2DS3K7RE56 304 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CCL22O00626 93 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TNFRSF10CO14798 259 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PIN1P1O15428 100 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TACSTD2P09758 323 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 BCL2P10415 239 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 EPORP19235 508 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CD33P20138 364 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 AADACP22760 399 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PTGER1P34995 402 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TCL1AP56279 114 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 GGTLC2Q14390 218 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 IL13RA2Q14627 380 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 KIR2DS3Q14952 304 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 SBSNQ6UWP8 590 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 GLB1LQ6UWU2 654 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PLXDC2Q6UX71 529 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TTC9CQ8N5M4 171 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 OR51T1Q8NGJ9 327 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 NRGNQ92686 78 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PELI1Q96FA3 418 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 NRN1Q9NPD7 142 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PIGVQ9NUD9 493 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 METRNQ9UJH8 293 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ATRXP46100 2492 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CKAP5Q14008 2032 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CEP250Q9BV73 2442 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A087WUU8 490 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 hADV38S2A0JD32 116 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 DCDC2BA2VCK2 349 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 LRP5LA4QPB2 252 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 GAGE12JA6NER3 117 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM72CH0Y354 149 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 HS3ST1O14792 307 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 GAGE7O76087 117 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 VENTXO95231 258 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM50AO95807 157 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHG4P01861 327 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 HLA-DRB1P01911 266 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CFIP05156 583 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC00869P0C866 280 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 SP9P0CG40 484 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 GAGE12FP0CL80 117 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 GAGE12GP0CL81 117 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 GAGE12IP0CL82 117 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 FABP6P51161 128 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TCTAP57738 103 aa5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms