RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470953.1

VARS-222, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene VARS, Length 392 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-222	ENST00000470953	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ODAM	A1E959	279 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	PSPN	O60542	156 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ZNF737	O75373	536 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	MAS1	P04201	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CEL	P19835	753 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	NFYB	P25208	207 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	OR3A4P	P47883	348 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	RAB13	P51153	203 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	VBP1	P61758	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	BLCAP	P62952	87 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	GPR176	Q14439	515 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ZNF146	Q15072	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	MED22	Q15528	200 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SSX2	Q16385	188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CDH26	Q8IXH8	852 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	PXT1	Q8NFP0	134 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	GGH	Q92820	318 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	GHSR	Q92847	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	UFD1	Q92890	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953		A0A1W2PPK0	400 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	RGS10	O43665	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	RAMP3	O60896	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CDRT1	O95170	752 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ALDOB	P05062	364 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CSN2	P05814	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	GTF2F2	P13984	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	FST	P19883	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CDK2	P24941	298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	HTR1D	P28221	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CEACAM3	P40198	252 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	VHL	P40337	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ECI1	P42126	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	GLIPR1	P48060	266 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	KCNJ3	P48549	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	THBS3	P49746	956 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	BCAP31	P51572	246 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	GNG2	P59768	71 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ZP1	P60852	638 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	AES	Q08117	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	GPR50	Q13585	617 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	LTC4S	Q16873	150 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	HCP5	Q6MZN7	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	STX12	Q86Y82	276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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