RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469034.1

SUMO1-210, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, humanhuman

TSL 3

Gene SUMO1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1-210ENST00000469034 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.01□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa4.01□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 EML6Q6ZMW3 1958 aa4.01□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 CEP192Q8TEP8 1941 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 A0A1B0GV50 99 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 ZNF850A8MQ14 1090 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 CDRT15L2A8MXV6 281 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 LMO7DNF2Z398 122 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 F5H5K5 113 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 DHHO43323 396 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 SYNGR3O43761 229 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 PIAS2O75928 621 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 F10P00742 488 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 PPYP01298 95 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 IFNA10P01566 189 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 TRGC2P03986 189 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 FAM90A13PP0C7W8 464 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 FAM90A24PP0C7X0 464 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 TRGC1P0CF51 173 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 RNF224P0DH78 156 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 RD3LP0DJH9 198 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 CD27P26842 260 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 GNRHRP30968 328 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 RBP2P50120 134 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 DYNLT3P51808 116 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 MTCP1P56278 107 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 TAS2R30P59541 319 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 FXYD4P59646 89 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 UBE2KP61086 200 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 DLK1P80370 383 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 OR8B8Q15620 311 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 ZNF674Q2M3X9 581 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 PIGYQ3MUY2 71 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 KHDC3LQ587J8 217 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 NMSQ5H8A3 153 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 FAM27BQ5VT28 67 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 Q6ZS49 121 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 C5orf24Q7Z6I8 188 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 RABEPKQ7Z6M1 372 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 ZNF429Q86V71 674 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 ZNF100Q8IYN0 542 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 FAM185AQ8N0U4 392 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 OSR2Q8N2R0 312 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 ZIC4Q8N9L1 334 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 Q8NFD4 153 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 GJC3Q8NFK1 279 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 OR10G3Q8NGC4 313 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 OR10AD1Q8NGE0 317 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 DNASE2BQ8WZ79 361 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 FRZBQ92765 325 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 TOMM40LQ969M1 308 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 PFDN5Q99471 154 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 GPR61Q9BZJ8 451 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 SLC25A31Q9H0C2 315 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 TMEM222Q9H0R3 208 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 CDH20Q9HBT6 801 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 DKKL1Q9UK85 242 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 LIPGQ9Y5X9 500 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 MTCH2Q9Y6C9 303 aa4□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 A0A1B0GV90 55 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 OR6C6A6NF89 314 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 B4DEV8 164 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 MKRN2OSH3BPM6 223 aa3.99□□□□□ -1.77
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SUMO1-210ENST00000469034 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 SLC31A2O15432 143 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 TGOLN2O43493 480 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 ADAM20O43506 726 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 ZIC3O60481 467 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 PDCD6O75340 191 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 TUSC2O75896 110 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 ZFAND5O76080 213 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 MYF5P13349 255 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 SELLP14151 372 aa3.99□□□□□ -1.77
SUMO1-210ENST00000469034 UCP1P25874 307 aa3.99□□□□□ -1.77
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