RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468108.1

CCDC66-211, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-211	ENST00000468108	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	MICU1	Q9BPX6	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	PKIB	Q9C010	78 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	RHOF	Q9HBH0	211 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CA10	Q9NS85	328 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	TMEM100	Q9NV29	134 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	RASL12	Q9NYN1	266 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SPTBN2	O15020	2390 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108		A0A0B4J2A0	478 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	TMEM210	A6NLX4	147 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	RHOD	O00212	210 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	BCL2L11	O43521	198 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CA11	O75493	328 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	KDM4B	O94953	1096 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	RLN1	P04808	185 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OR4E1	P0C645	316 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	AGA	P20933	346 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CA6	P23280	308 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CPT2	P23786	658 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CD34	P28906	385 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	PMEL	P40967	661 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FABP6	P51161	128 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF83	P51522	516 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	GPM6A	P51674	278 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	TMEM50B	P56557	158 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	H2BFS	P57053	126 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SELENOV	P59797	346 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CALHM1	Q8IU99	346 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OR8S1	Q8NH09	359 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OR51F2	Q8NH61	342 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	AQP3	Q92482	292 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SEH1L	Q96EE3	360 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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