RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	ODAM	A1E959	279 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM25E	A8MYX2	175 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM178B	H3BS89	294 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	LGALS8	O00214	317 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	HSD17B6	O14756	317 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	RGS11	O94810	467 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5AC1	P0C628	307 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	SELL	P14151	372 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	IL2RG	P31785	369 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	P2RX3	P56373	397 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	RND3	P61587	244 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435		Q5BKY6	102 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	GALM	Q96C23	342 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	GALNT14	Q96FL9	552 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	LURAP1	Q96LR2	239 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB18	Q9NP72	206 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	RDH8	Q9NYR8	311 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	DUX4	Q9UBX2	424 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	ITPR1	Q14643	2758 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	C5orf51	A6NDU8	294 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	PPIAL4D	F5H284	164 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	HBZ	P02008	142 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	GNRHR	P30968	328 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	SSTR5	P35346	364 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	PPOX	P50336	477 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	EDDM3B	P56851	147 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	CCL17	Q92583	94 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	CCL13	Q99616	98 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	HSPB11	Q9Y547	144 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	C19orf84	I3L1E1	186 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	SIGLEC5	O15389	551 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	MPPED1	O15442	326 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	SPINT2	O43291	252 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	ADAP1	O75689	374 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	CD8A	P01732	235 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	HEXA	P06865	529 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	CEACAM6	P40199	344 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM187	Q14656	261 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	GNMT	Q14749	295 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	SP6	Q3SY56	376 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	NINJ1	Q92982	152 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	ARL11	Q969Q4	196 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	C14orf79	Q96F83	325 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	SEC22A	Q96IW7	307 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	COMMD9	Q9P000	198 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435		B8ZZF3	427 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	C15orf65	H3BRN8	121 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	PRB1	P04280	392 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	HOXB5	P09067	269 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	S100G	P29377	79 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	FGL1	Q08830	312 aa		10.23	□□□□□ -0.77

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