RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466832.5

TRA2B-209, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 2

Gene TRA2B, Length 2,414 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-209	ENST00000466832	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TACC2	O95359	2948 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832		H0YIZ8	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	DEGS1	O15121	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	IGHG3	P01860	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	HKR1	P10072	659 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	GABRR1	P24046	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	S100G	P29377	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	APLNR	P35414	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	KCNJ3	P48549	501 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	GAPT	Q8N292	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR51F2	Q8NH61	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TMEM210	A6NLX4	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832		G3V3Y1	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832		K7EPK0	472 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	MSTN	O14793	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TK1	P04183	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	GLRA1	P23415	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PIGP	P57054	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	GNG3	P63215	75 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PRDX4	Q13162	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SLC10A1	Q14973	349 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR8G1	Q15617	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SVBP	Q8N300	66 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ABHD3	Q8WU67	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832		J3QT63	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	GPR31	O00270	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	HEXA	P06865	529 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	CD200	P41217	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	F2RL1	P55085	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PLGLB1	Q02325	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	BAX	Q07812	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF273	Q14593	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TAF9	Q16594	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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