RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa20.57■□□□□ 0.88
PBRM1-218ENST00000458294 IGHV3-43DP0DP04 118 aa20.57■□□□□ 0.88
PBRM1-218ENST00000458294 ALDH3A2P51648 485 aa20.57■□□□□ 0.88
PBRM1-218ENST00000458294 RAB40BQ12829 278 aa20.57■□□□□ 0.88
PBRM1-218ENST00000458294 ATAD3CQ5T2N8 411 aa20.57■□□□□ 0.88
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF497Q6ZNH5 498 aa20.57■□□□□ 0.88
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PBRM1-218ENST00000458294 GPR148Q8TDV2 347 aa20.57■□□□□ 0.88
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC107Q8WV48 283 aa20.57■□□□□ 0.88
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PBRM1-218ENST00000458294 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa20.57■□□□□ 0.88
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PBRM1-218ENST00000458294 F2RL1P55085 397 aa20.56■□□□□ 0.88
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PBRM1-218ENST00000458294 CT45A3Q8NHU0 189 aa20.52■□□□□ 0.88
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PBRM1-218ENST00000458294 STEAP3Q658P3 488 aa20.51■□□□□ 0.87
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PBRM1-218ENST00000458294 XAF1Q6GPH4 301 aa20.49■□□□□ 0.87
PBRM1-218ENST00000458294 TRAT1Q6PIZ9 186 aa20.49■□□□□ 0.87
PBRM1-218ENST00000458294 CBR4Q8N4T8 237 aa20.49■□□□□ 0.87
PBRM1-218ENST00000458294 OR10V1Q8NGI7 309 aa20.49■□□□□ 0.87
PBRM1-218ENST00000458294 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PBRM1-218ENST00000458294 ETAA1Q9NY74 926 aa20.49■□□□□ 0.87
PBRM1-218ENST00000458294 SACSQ9NZJ4 4579 aa20.49■□□□□ 0.87
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