RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 STARD4Q96DR4 205 aa13.02□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PGLYRP3Q96LB9 341 aa13.02□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NAT1P18440 290 aa13.02□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NUMA1Q14980 2115 aa13.02□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VAX1Q5SQQ9 334 aa13.02□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SCGB1D4Q6XE38 83 aa13.02□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZPLD1Q8TCW7 415 aa13.02□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UCN2Q96RP3 112 aa13.02□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PPC1 479 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MELTFP08582 738 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLDN18P56856 261 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UBE2V2Q15819 145 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR1L8Q8NGR8 309 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EML2O95834 649 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPINK2P20155 84 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LHFPL5Q8TAF8 219 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KCNMB2Q9Y691 235 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CD99P14209 185 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR1K1Q8NGR3 316 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VSIG10L2P0DP72 767 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC35E4Q6ICL7 350 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GBGT1Q8N5D6 347 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A0U1RQV5 110 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF205O95201 554 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NGFRP08138 427 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ASAH2BP0C7U1 165 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BCL2P10415 239 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MGAT2Q10469 447 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDFY1Q8IWB7 410 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MS4A5Q9H3V2 200 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CXCL2P19875 107 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR2I1PQ8NGU4 316 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYOZ3Q8TDC0 251 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MIOXQ9UGB7 285 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DTX4Q9Y2E6 619 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGKV1D-16P01601 117 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COL10A1Q03692 680 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FSCN3Q9NQT6 498 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TREM2Q9NZC2 230 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 B4E171 279 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HPRT1P00492 218 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSPAN7P41732 249 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBXW9Q5XUX1 488 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR2D3Q8NGH3 330 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CFHR5Q9BXR6 569 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLN8Q9UBY8 286 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIGD1AQ9Y241 93 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPINT1O43278 529 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SERF2P84101 59 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRSS27Q9BQR3 290 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 INSIG2Q9Y5U4 225 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H0Y980 276 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RHBDL1O75783 438 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AESQ08117 197 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLPPR5Q32ZL2 321 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MDP1Q86V88 176 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM52Q8NDY8 209 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MGPP08493 103 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LIMS1P48059 325 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UCNP55089 124 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPL24P83731 157 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMRP1Q8NCR6 262 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PRD5 423 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PRF3 423 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PRM7 423 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FOXS1O43638 330 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCL4P13236 92 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PAFAH1B2P68402 229 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 J3QR06 171 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DXOO77932 396 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGSF11Q5DX21 431 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TEX30Q5JUR7 227 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LDLRAD3Q86YD5 345 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DIRC2Q96SL1 478 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms