RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 HBZP02008 142 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 ISG15P05161 165 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 GABRA1P14867 456 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 IHHQ14623 411 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 NATD1Q8N6N6 113 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR51H1Q8NH63 302 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR10D3Q8NH80 312 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNRF2Q8NHG8 242 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 ERMNQ8TAM6 284 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 CMBLQ96DG6 245 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 B9D2Q9BPU9 175 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 TIPINQ9BVW5 301 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR51B6Q9H340 312 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 MAP1LC3AQ9H492 121 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 LINC00527Q9UJ94 153 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 YEATS2Q9ULM3 1422 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 SVILO95425 2214 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR5H14A6NHG9 310 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARGFXA6NJG6 315 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 M0R036 132 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 COPEO14579 308 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACOX3O15254 700 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 TGOLN2O43493 480 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 SULT1A2P50226 295 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 LINC00315P59091 139 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 CXCR4P61073 352 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 MOBPQ13875 183 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM69Q5SWH9 247 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 HES3Q5TGS1 186 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 Q6ZRU5 148 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 TCF23Q7RTU1 214 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPRMLQ8N4K4 120 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPPL2BQ8TCT7 592 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCTD4Q8WVF5 259 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 TLCD1Q96CP7 247 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR7D2Q96RA2 312 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 DERL2Q9GZP9 239 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 GTSF1LQ9H1H1 148 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF586Q9NXT0 402 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF492Q9P255 531 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 MYO5BQ9ULV0 1848 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 NPATQ14207 1427 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 RBBP9O75884 186 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPR75O95800 540 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 HLA-DRAP01903 254 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATP5G1P05496 136 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 CRYBA1P05813 215 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 FBP1P09467 338 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF286BP0CG31 522 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 CGB3P0DN86 165 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 CGB7P0DN87 165 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 S100A2P29034 98 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 EVI2BP34910 448 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 CEBPGP53567 150 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 FMODQ06828 376 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 FADDQ13158 208 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 EBPQ15125 230 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 LCE1EQ5T753 118 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 LPCAT4Q643R3 524 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZFAND6Q6FIF0 208 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 HMGN2P46Q86SG4 172 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 YIPF7Q8N8F6 280 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 RAB8BQ92930 207 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMBIM1Q969X1 311 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 TESCQ96BS2 214 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 OPTNQ96CV9 577 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR2V2Q96R30 315 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIB3Q96RU7 358 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 SCRT1Q9BWW7 348 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 GNB1LQ9BYB4 327 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 C11orf49Q9H6J7 331 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 LRRC19Q9H756 370 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 GUCA1BQ9UMX6 200 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF835Q9Y2P0 537 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCM1Q15154 2024 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-272P-201ENST00000411028 SCN4AP35499 1836 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-272P-201ENST00000411028 BRWD3Q6RI45 1802 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-272P-201ENST00000411028 A8MWP4 228 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-272P-201ENST00000411028 B4DEV8 164 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-272P-201ENST00000411028 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms