RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409627.6

SUMO1-208, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 722 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-208	ENST00000409627		A0A087X0M5	115 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627		A0A1B0GX30	115 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	TRDC	B7Z8K6	153 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	SULT1C2	O00338	296 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	FSHB	P01225	129 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	KIR2DS4	P43632	304 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	DLX1	P56177	255 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	KIR2DS1	Q14954	304 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	OR1L1	Q8NH94	360 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	RFESD	Q8TAC1	157 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	NANP	Q8TBE9	248 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	LHX4	Q969G2	390 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	SOST	Q9BQB4	213 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SUMO1-208	ENST00000409627	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	LPL	P06858	475 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	CD34	P28906	385 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	HTD2	P86397	168 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	GUCA2A	Q02747	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	MADCAM1	Q13477	382 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	HCP5	Q6MZN7	132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	CCDC190	Q86UF4	302 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	PRR18	Q8N4B5	295 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	UBALD1	Q8TB05	177 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	GPX8	Q8TED1	209 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	GALM	Q96C23	342 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	ABHD1	Q96SE0	405 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	MEIOC	A2RUB1	952 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	FABP12	A6NFH5	140 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	FABP7	O15540	132 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	DIRAS3	O95661	229 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	ETV6	P41212	452 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	UBE2E1	P51965	193 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	LOXL3	P58215	753 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	KLRD1	Q13241	179 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	IL18	Q14116	193 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	JPT1	Q9UK76	154 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	CTDSPL	O15194	276 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	IGHV1-69	P01742	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	SCT	P09683	121 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	COX7A1	P24310	79 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	NFYB	P25208	207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	BPIFB3	P59826	476 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	LTC4S	Q16873	150 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627		Q3ZCU0	254 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	PNKD	Q8N490	385 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	IFT46	Q9NQC8	304 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627		V9GYH0	126 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	INAFM1	C9JVW0	142 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	GABARAP	H6UMI1	98 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	GSTT2	P0CG29	244 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	GSTT2B	P0CG30	244 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF626	Q68DY1	528 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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