RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 WRBO00258 174 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 HSPA12AO43301 675 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 WNT2P09544 360 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 MMP9P14780 707 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 ASCL1P50553 236 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 CLINT1Q14677 625 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 TMEM88Q6PEY1 159 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 TAAR3PQ9P1P4 343 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 AGFG2O95081 481 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 PSG2P11465 335 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 OMGP23515 440 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 SNCAP37840 140 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 TESK1Q15569 626 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 DEFB109BQ30KR1 87 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 WDR31Q8NA23 367 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 AKR1E2Q96JD6 320 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 C19orf12Q9NSK7 152 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 TINAGQ9UJW2 476 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 WIPI2Q9Y4P8 454 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-202ENST00000398743 FAM157AC9JC47 383 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 IGLV2-14P01704 120 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 NPBWR1P48145 328 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 FHITP49789 147 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 BAXQ07812 192 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 IGF2-ASQ6U949 168 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 OR8G5Q8NG78 346 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 OR14J1Q9UGF5 321 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 MED12LQ86YW9 2145 aa11.71□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 FAM186AA6NE01 2351 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 A0A1B0GU03 582 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 PROB1E7EW31 1015 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 MLNRO43193 412 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 CHST1O43916 411 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 C1QL1O75973 258 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 NXPH3O95157 252 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 HAND1O96004 215 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 SLC25A6P12236 298 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 HMGN3Q15651 99 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 OR5C1Q8NGR4 320 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 HES4Q9HCC6 221 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 A0A0G2JRQ6 117 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 C9JQL5 133 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 WDR1O75083 606 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 TMEM50AO95807 157 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 EPHA1P21709 976 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 FOXF2Q12947 444 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 CBLN2Q8IUK8 224 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 GPR146Q96CH1 333 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 DOCK7Q96N67 2140 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 RNF115Q9Y4L5 304 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 AHRRA9YTQ3 701 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 HEXAP06865 529 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 CECR9P0C854 216 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 CTRB1P17538 263 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 TUBG1P23258 451 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 ATP6V0CP27449 155 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 DYNLT3P51808 116 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 PEA15Q15121 130 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 CTRB2Q6GPI1 263 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 UBALD1Q8TB05 177 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 CXXC4Q9H2H0 198 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 K7N7A8 449 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 PSPNO60542 156 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 CST7O76096 145 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 H2AFB1P0C5Y9 115 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 CEACAM6P40199 344 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 PPT1P50897 306 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 GUK1Q16774 197 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 ODF3L1Q8IXM7 274 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 FAM213BQ8TBF2 198 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 KCNIP1Q9NZI2 227 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 NDRG3Q9UGV2 375 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 KPTNQ9Y664 436 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-202ENST00000398743 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms