RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa12.42□□□□□ -0.42
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0B4J203 849 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV39A0A0B4J263 110 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A6NJ64 397 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VGLL3A8MV65 326 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NFYBP25208 207 aa12.41□□□□□ -0.42
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LSM3P62310 102 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4P4Q8NGL7 312 aa12.41□□□□□ -0.42
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF286AQ9HBT8 521 aa12.41□□□□□ -0.42
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 DPM3Q9P2X0 92 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA2Q9UM82 520 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF212BA8MTL3 300 aa12.4□□□□□ -0.42
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 OOSP1A8MZH6 123 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGDIBP52566 201 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCS1P62166 190 aa12.4□□□□□ -0.42
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLA2G7Q13093 441 aa12.4□□□□□ -0.42
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTF1Q16619 201 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HLA-DRB5Q30154 266 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDNFQ8TB73 568 aa12.4□□□□□ -0.42
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MMP28Q9H239 520 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP12.4□□□□□ -0.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RHBDL2Q9NX52 303 aa12.4□□□□□ -0.42
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV4-59P01825 116 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD3GP09693 182 aa12.39□□□□□ -0.43
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C16orf87Q6PH81 154 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa12.39□□□□□ -0.43
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00311Q8N616 119 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHF21AQ96BD5 680 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VPREB3Q9UKI3 123 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSG11Q9UQ72 335 aa12.39□□□□□ -0.43
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LY6G6FQ5SQ64 297 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB2BQ8WUD1 216 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C17orf50Q8WW18 174 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACOT12Q8WYK0 555 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSX3Q99909 188 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C19orf24Q9BVV8 132 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q9N2K0 584 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2S2Q9NQN1 319 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNG12Q9UBI6 72 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C2CD3Q4AC94 2353 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGS11O94810 467 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNB3P16520 340 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIR2DS4P43632 304 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RORCP51449 518 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMBIM6P55061 237 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PITPNAQ00169 270 aa12.37□□□□□ -0.43
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