RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376726.3

ACSS1-202, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ACSS1, Length 2,244 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-202ENST00000376726 PARP11Q9NR21 331 aa20.55■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 ZNF826PQ6ZT77 177 aa20.55■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 IL1F10Q8WWZ1 152 aa20.55■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 UCP1P25874 307 aa20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 FAM169BQ8N8A8 192 aa20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 TMEM231Q9H6L2 316 aa20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 UQCC1Q9NVA1 299 aa20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 OR1A1Q9P1Q5 309 aa20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 FAM74A7A6NL05 159 aa20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 CRYABP02511 175 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 GCH1P30793 250 aa20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 GUCA2BQ16661 112 aa20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 FAM74A3Q4VXF1 159 aa20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 SVBPQ8N300 66 aa20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 TREM1Q9NP99 234 aa20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 OR14J1Q9UGF5 321 aa20.54■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 TNFSF12O43508 249 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 HAND1O96004 215 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 GNMTQ14749 295 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 C1orf185Q5T7R7 199 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 GINS3Q9BRX5 216 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 MSL2Q9HCI7 577 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 F8W036 122 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 TRIM77I1YAP6 450 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 WNT9BO14905 357 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 NHLH2Q02577 135 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 SMUG1Q53HV7 270 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 TAAR3PQ9P1P4 343 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa20.52■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 ASCL5Q7RTU5 278 aa20.52■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 PRR18Q8N4B5 295 aa20.52■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 LYPD6BQ8NI32 183 aa20.52■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 SPIN2AQ99865 258 aa20.52■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa20.52■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 TLNRD1Q9H1K6 362 aa20.52■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 WASF3Q9UPY6 502 aa20.52■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 FAM96BQ9Y3D0 163 aa20.52■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 WIPI2Q9Y4P8 454 aa20.52■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 MGAQ8IWI9 3026 aa20.52■□□□□ 0.88
ACSS1-202ENST00000376726 CLEC18AA5D8T8 446 aa20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 SEC11BP0C7V7 166 aa20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 F2RL1P55085 397 aa20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 NMSQ5H8A3 153 aa20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 Q6ZRG5 221 aa20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 CLEC18CQ8NCF0 446 aa20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 A6NLC8 198 aa20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 H0Y980 276 aa20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 C1orf174Q8IYL3 243 aa20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 OR10V1Q8NGI7 309 aa20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 OR5D13Q8NGL4 314 aa20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 SEC11CQ9BY50 192 aa20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 ADAM20O43506 726 aa20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 PSPNO60542 156 aa20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 SPP1P10451 314 aa20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 WDR82Q6UXN9 313 aa20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 SPAG16Q8N0X2 631 aa20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 S100PBPQ96BU1 408 aa20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 F2RP25116 425 aa20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 S100GP29377 79 aa20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 ID4P47928 161 aa20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 TESK1Q15569 626 aa20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 OR2C3Q8N628 320 aa20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 UBALD1Q8TB05 177 aa20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 ABHD14BQ96IU4 210 aa20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 UFSP2Q9NUQ7 469 aa20.5■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 VDAC1P21796 283 aa20.49■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 LMO1P25800 156 aa20.49■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 TIMP3P35625 211 aa20.49■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 ZNF83P51522 516 aa20.49■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 HMGN3Q15651 99 aa20.49■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 ACP7Q6ZNF0 438 aa20.49■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 IL22RA2Q969J5 263 aa20.49■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 CD5P06127 495 aa20.49■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 DANCRP0C864 163 aa20.49■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 SWI5Q1ZZU3 235 aa20.49■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 TIMM23BQ5SRD1 257 aa20.49■□□□□ 0.87
ACSS1-202ENST00000376726 ALKBH2Q6NS38 261 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms