RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326197.11

SCMH1-201, Transcript of Scm polycomb group protein homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCMH1, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1-201ENST00000326197 SSR4P51571 173 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 PMP22Q01453 160 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 COL10A1Q03692 680 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 SRYQ05066 204 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 BSXQ3C1V8 233 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 OR1P1Q8NH06 330 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 FUT9Q9Y231 359 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 KNTC1P50748 2209 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 SYNGR2O43760 224 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 TUSC2O75896 110 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 UCP1P25874 307 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 GUSBP11Q6P575 273 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 OR14J1Q9UGF5 321 aa8.7□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 DNAJC13O75165 2243 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 C9J4A7 227 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CD55P08174 381 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CST2P09228 141 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 BMP5P22003 454 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CRYGSP22914 178 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 F2RP25116 425 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CLDN15P56746 228 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CD81P60033 236 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 PRDX4Q13162 271 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 RTP5Q14D33 572 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 ZNF488Q96MN9 340 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 OR51I2Q9H344 312 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 NAT8Q9UHE5 227 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 RNF150Q9ULK6 438 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CTXN2P0C2S0 81 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 LIFP15018 202 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 FOXO1Q12778 655 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 ZNF124Q15973 351 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 NMSQ5H8A3 153 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 ZNF709Q8N972 641 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 ATG101Q9BSB4 218 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 A0A0G2JRQ6 117 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 C5orf49A4QMS7 147 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 C3orf80F5H4A9 247 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 AMBPP02760 352 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 P04436 131 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 APLNRP35414 380 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CHRNA7P36544 502 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 MLF1P58340 268 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 RAC1P63000 192 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 EXT1Q16394 746 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 HLA-BQ31612 363 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 LRP11Q86VZ4 500 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 FADS6Q8N9I5 356 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CLDN23Q96B33 292 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 TMEM18Q96B42 140 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 ABHD14BQ96IU4 210 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 ADGRG7Q96K78 797 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.69□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 H0Y980 276 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 SELLP14151 372 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 LMO1P25800 156 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CCL7P80098 99 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 P2RY6Q15077 328 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CST9LP1Q5W188 147 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 OR5D13Q8NGL4 314 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 DDA1Q9BW61 102 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 PI4KAP42356 2102 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 GDF9O60383 454 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 COL19A1Q14993 1142 aa8.68□□□□□ -1.02
SCMH1-201ENST00000326197 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms