RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302273.2

VPREB1-201, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene VPREB1, Length 626 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1-201ENST00000302273 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ENKURQ8TC29 256 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 GALMQ96C23 342 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 NICN1Q9BSH3 213 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 BEX2Q9BXY8 128 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 PECRQ9BY49 303 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MMP28Q9H239 520 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 KIF25Q9UIL4 384 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 A0A0A6YYD4 124 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 A0A0B4J203 849 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MEIOCA2RUB1 952 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 F2RL2O00254 374 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SULT1C2O00338 296 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 LYRM1O43325 122 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CRLF1O75462 422 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 FSHBP01225 129 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CD3GP09693 182 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 FPR2P25090 351 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 INPP1P49441 399 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 EFNB2P52799 333 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CDNFQ49AH0 187 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 GPR157Q5UAW9 335 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 Q8N7P7 452 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF596Q8TC21 504 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TRIM63Q969Q1 353 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 NUP50Q9UKX7 468 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.26□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 A0A0A6YYJ9 748 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 UBE2QL1A1L167 161 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 HMX3A6NHT5 357 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TRDCB7Z8K6 153 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 C15orf65H3BRN8 121 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 HSPB6O14558 160 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ITGB1BP1O14713 200 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CTDSPLO15194 276 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 LANCL1O43813 399 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 RGS11O94810 467 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TFF1P04155 84 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 FAM157CP0CG43 387 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CDK2P24941 298 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 PRRX1P54821 245 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CBX3Q13185 183 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ARFRP1Q13795 201 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF273Q14593 569 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 AANATQ16613 207 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TCF23Q7RTU1 214 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 DYRK2Q92630 601 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ABHD1Q96SE0 405 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TBX15Q96SF7 602 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SMR3AQ99954 134 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 Q9N2K0 584 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CALYQ9NYX4 217 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 AK3Q9UIJ7 227 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 JPT1Q9UK76 154 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms