RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.22□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 NXPH1P58417 271 aa8.22□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 HYAL1Q12794 435 aa8.22□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.22□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 COX6B1P14854 86 aa8.22□□□□□ -1.09
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CUX1-201ENST00000292535 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.2□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 TIMP4Q99727 224 aa8.2□□□□□ -1.1
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CUX1-201ENST00000292535 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.2□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 IL19Q9UHD0 177 aa8.2□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa8.2□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 TMEM189A5PLL7 270 aa8.2□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 OR2A4O95047 310 aa8.2□□□□□ -1.1
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