RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 ESPL1Q14674 2120 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR6C3Q9NZP0 311 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 PDE6DO43924 150 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF137PP52743 207 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 D2HGDHQ8N465 521 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 KCNE5Q9UJ90 142 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 PITX3O75364 302 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 NGFRP08138 427 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 ONECUT1Q9UBC0 465 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 OOEPA6NGQ2 149 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCL4P13236 92 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 TCTAP57738 103 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 PCGF1Q9BSM1 259 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 NAGKQ9UJ70 344 aa11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRAV17A0A0B4J275 112 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 hADV38S2A0JD32 116 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 FHITP49789 147 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM140Q9NV12 185 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 DXOO77932 396 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 FSTP19883 344 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 TNXAQ16473 311 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM97Q5BJF2 176 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 C5orf17Q8NAS9 161 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 HSPB9Q9BQS6 159 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 CXXC4Q9H2H0 198 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 F5H697 171 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 P01737 135 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 RARRES2Q99969 163 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 COL4A1P02462 1669 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 MIA3Q5JRA6 1907 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 J3QT63 122 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 HKR1P10072 659 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 TGIF1Q15583 401 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR51M1Q9H341 326 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 GPR35Q9HC97 309 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM38BQ9NVV0 291 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 RNF24Q9Y225 148 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 SCN2AQ99250 2005 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 APELAP0DMC3 54 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 AESQ08117 197 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 RAB24Q969Q5 203 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A1W2PRD5 423 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A1W2PRF3 423 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A1W2PRM7 423 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 RBM11P57052 281 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 COX19Q49B96 90 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMPRSS2O15393 492 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 NDUFB4O95168 129 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 WNT5AP41221 380 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR2M3Q8NG83 312 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 MOSPD3O75425 235 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 KIR2DS2P43631 304 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 HIKESHIQ53FT3 197 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF721Q8TF20 911 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 STRCQ7RTU9 1775 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 MKRN2OSH3BPM6 223 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 CD99P14209 185 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 RPL7P18124 248 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 CD40P25942 277 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 NPY1RP25929 384 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 MFAP2P55001 183 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 SSPNQ14714 243 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR4A4PQ8NGN8 299 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 TUBD1Q9UJT1 453 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 UFC1Q9Y3C8 167 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 C4orf51C9J302 202 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 MELTFP08582 738 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 CD81P60033 236 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 PCED1AQ9H1Q7 454 aa11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPTBN2O15020 2390 aa11.84□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 MAGEA5P43359 124 aa11.84□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.84□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 RNF122Q9H9V4 155 aa11.84□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 PAPPAQ13219 1627 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms