RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 A0A0G2JRQ6 117 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 FAM122CQ6P4D5 195 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 TAAR3PQ9P1P4 343 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 TRAV17A0A0B4J275 112 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 PROB1E7EW31 1015 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 WRBO00258 174 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 SH2D1BO14796 132 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 TMEM50AO95807 157 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 SERPINE2P07093 398 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 HOXC12P31275 282 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 RAB5CP51148 216 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 ZNF266Q14584 549 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 AKR1E2Q96JD6 320 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 PRR14LQ5THK1 2151 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 GTF3C1Q12789 2109 aa16.28■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa16.27■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 AQP7O14520 342 aa16.27■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 HSPA12AO43301 675 aa16.27■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 ZNF146Q15072 292 aa16.27■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 TESK1Q15569 626 aa16.27■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 COMMD1Q8N668 190 aa16.27■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 TMEM171Q8WVE6 324 aa16.27■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 OBP2BQ9NPH6 170 aa16.27■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 OR14J1Q9UGF5 321 aa16.27■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 TINAGQ9UJW2 476 aa16.27■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 RFNGQ9Y644 331 aa16.27■□□□□ 0.2
USP21-201ENST00000289865 CHST1O43916 411 aa16.27■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 CST7O76096 145 aa16.27■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 CBR1P16152 277 aa16.27■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 CTRB1P17538 263 aa16.27■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 NFYBP25208 207 aa16.27■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 SHEQ5VZ18 495 aa16.27■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 CTRB2Q6GPI1 263 aa16.27■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 ODF3L1Q8IXM7 274 aa16.27■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 OR5C1Q8NGR4 320 aa16.27■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 GPR146Q96CH1 333 aa16.27■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 IGLV2-14P01704 120 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 PPT1P50897 306 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 DYNLT3P51808 116 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 GUK1Q16774 197 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 WDR31Q8NA23 367 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 FAM213BQ8TBF2 198 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 KCNS2Q9ULS6 477 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 TMEM210A6NLX4 147 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 MMP9P14780 707 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 COX5AP20674 150 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 ATP6V0CP27449 155 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 TMEM217Q8N7C4 229 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 SARAFQ96BY9 339 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 NDRG3Q9UGV2 375 aa16.26■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 ASPMQ8IZT6 3477 aa16.25■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 A0A1B0GV50 99 aa16.25■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 K7N7A8 449 aa16.25■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 HAND1O96004 215 aa16.25■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 IGKV3-15P01624 115 aa16.25■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 H2AFB1P0C5Y9 115 aa16.25■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 HFEQ30201 348 aa16.25■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 DEFB109BQ30KR1 87 aa16.25■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 OR2G3Q8NGZ4 309 aa16.25■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 RNF115Q9Y4L5 304 aa16.25■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 CACNA1GO43497 2377 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 ZFHX4Q86UP3 3567 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 MLNRO43193 412 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 FOXF2Q12947 444 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 PEA15Q15121 130 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 SCRT1Q9BWW7 348 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 WIPI2Q9Y4P8 454 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 A0A1B0GU03 582 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 WNT9BO14905 357 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 IGKV1-39P01597 117 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 IGKV1D-39P04432 117 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 PAX9P55771 341 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 BAXQ07812 192 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 HMGN3Q15651 99 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 ZNF826PQ6ZT77 177 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 OR8G5Q8NG78 346 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 FZR1Q9UM11 496 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 KPTNQ9Y664 436 aa16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
USP21-201ENST00000289865 PRR33A8MZF0 331 aa16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms