RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
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GGPS1-201ENST00000282841 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.21□□□□□ -0.93
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GGPS1-201ENST00000282841 MRGPRDQ8TDS7 321 aa9.21□□□□□ -0.93
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GGPS1-201ENST00000282841 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.21□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa9.21□□□□□ -0.94
GGPS1-201ENST00000282841 TUBAL3A6NHL2 446 aa9.21□□□□□ -0.94
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