RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 Q96M66 194 aa7.27□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 CST11Q9H112 138 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 HSPB6O14558 160 aa7.26□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 FGF16O43320 207 aa7.26□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 UCHL1P09936 223 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 FAM106CPP0CH98 169 aa7.26□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 SSTR5P35346 364 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 RAB13P51153 203 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 ZNF137PP52743 207 aa7.26□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 TPBGQ13641 420 aa7.26□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 C6orf183Q5T699 404 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 STEAP3Q658P3 488 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 AWAT2Q6E213 333 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 TMEM219Q86XT9 240 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.26□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 A0A1W2PPI3 338 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 AIPO00170 330 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 CCRL2O00421 344 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 TXNL1O43396 289 aa7.25□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 FUT3P21217 361 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 IL3RAP26951 378 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 TOMM40LQ969M1 308 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.25□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 ERICH4A6NGS2 130 aa7.24□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 LPLP06858 475 aa7.24□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 BLCAPP62952 87 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 RAB12Q6IQ22 244 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 TMEM104Q8NE00 496 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 ARL11Q969Q4 196 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.24□□□□□ -1.25
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