RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	NPB	Q8NG41	125 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	SORT1	Q99523	831 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CHP1	Q99653	195 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440		U3KQV3	271 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440		A8MT66	165 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440		C9JCJ5	164 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440		J3QT63	122 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	FCN1	O00602	326 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	RGS13	O14921	159 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CHP2	O43745	196 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC16A7	O60669	478 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CST4	P01036	141 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	C2	P06681	752 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	FUT1	P19526	365 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CD247	P20963	164 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	SSTR1	P30872	391 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP5G2	Q06055	141 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	LSAMP	Q13449	338 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	MLANA	Q16655	118 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	RITA1	Q96K30	269 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	NEU1	Q99519	415 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	ODAM	A1E959	279 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5B21	A6NL26	309 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	XKRY	O14609	159 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	OR7A10	O76100	309 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	EPHA2	P29317	976 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CRYBA2	P53672	197 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CRISP1	P54107	249 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	RGN	Q15493	299 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	MAPK11	Q15759	364 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	UNC50	Q53HI1	259 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	AMELY	Q99218	206 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440		M0R2T5	61 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CGB7	P0DN87	165 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	ARL3	P36405	182 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	GLP1R	P43220	463 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	HAAO	P46952	286 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	OR3A1	P47881	315 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKX	P51817	358 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	RHOG	P84095	191 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF148	Q8N7C7	305 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	FCGR1B	Q92637	280 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	GGH	Q92820	318 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	JAM3	Q9BX67	310 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CDIP1	Q9H305	208 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CALY	Q9NYX4	217 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4	□□□□□ -1.77

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