RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 NDNFQ8TB73 568 aa20.1■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 MRGPRDQ8TDS7 321 aa20.1■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 H3BUI4 141 aa20.09■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 GLAP06280 429 aa20.09■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 GZMHP20718 246 aa20.09■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 FABP5Q01469 135 aa20.09■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 RAB12Q6IQ22 244 aa20.09■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 BRICD5Q6PL45 260 aa20.09■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 ZNF497Q6ZNH5 498 aa20.09■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 NEK7Q8TDX7 302 aa20.09■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa20.09■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 DPM3Q9P2X0 92 aa20.09■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 FAM172BPA6NC97 362 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 MCRIP1C9JLW8 97 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 SLC22A1O15245 554 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 HTR2CP28335 458 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 SSX1Q16384 188 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 CNPY1Q3B7I2 92 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 PLA1AQ53H76 456 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 SVOPQ8N4V2 548 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 WFDC12Q8WWY7 111 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 CREB3L1Q96BA8 519 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 TCF19Q9Y242 345 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 HILPDAQ9Y5L2 63 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-220ENST00000618056 MGAM2Q2M2H8 2515 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 MT-ND4P03905 459 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 VSIG8P0DPA2 414 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 FUT3P21217 361 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 NFYBP25208 207 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 SSTR5P35346 364 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 PRRX1P54821 245 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 NEDD8Q15843 81 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 HLA-DRB5Q30154 266 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 SIGIRRQ6IA17 410 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 GAPTQ8N292 157 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 OR6M1Q8NGM8 313 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 OR9G1Q8NH87 305 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 SGMS2Q8NHU3 365 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 FAM46BQ96A09 425 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 NDUFB11Q9NX14 153 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 RNF114Q9Y508 228 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 TRAV39A0A0B4J263 110 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 TOR1AO14656 332 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 CA11O75493 328 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 RAB13P51153 203 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 UTF1Q5T230 341 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 SPARTQ8N0X7 666 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 GFI1Q99684 422 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 PEX16Q9Y5Y5 336 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 LEUTXA8MZ59 168 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 PDCD6O75340 191 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 MPIG6BO95866 241 aa20.05■□□□□ 0.8
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PMS1-220ENST00000618056 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa20.05■□□□□ 0.8
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PMS1-220ENST00000618056 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
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PMS1-220ENST00000618056 CEPT1Q9Y6K0 416 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 A6NDX4 124 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 AIPO00170 330 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 SLC17A2O00624 439 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 ORC5O43913 435 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 CHST1O43916 411 aa20.05■□□□□ 0.8
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PMS1-220ENST00000618056 PROK1P58294 105 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 TMEM59Q9BXS4 323 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 MMP28Q9H239 520 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 ETAA1Q9NY74 926 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 WNK1Q9H4A3 2382 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 TMEM14DPA8MWL7 114 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 LY6LH3BQJ8 138 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 C15orf65H3BRN8 121 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 QRFPP83859 136 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 UNC119Q13432 240 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 OR10K2Q6IF99 312 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 OR52M1Q8NGK5 317 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 TM2D1Q9BX74 207 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 FBLN5Q9UBX5 448 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 J3QR06 171 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 F2RL2O00254 374 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 OR4C13Q8NGP0 309 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 CCDC107Q8WV48 283 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 FCGR1BQ92637 280 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 ARL11Q969Q4 196 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 TSC22D3Q99576 134 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-220ENST00000618056 PLGRKTQ9HBL7 147 aa20.03■□□□□ 0.8
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