RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566613.1

GDPD3-205, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 3, human

TSL 5

Gene GDPD3, Length 235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GDPD3-205	ENST00000566613	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	DOK4	Q8TEW6	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF480	Q8WV37	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	ATP5S	Q99766	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	THADA	Q6YHU6	1953 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	ARL5C	A6NH57	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	MLNR	O43193	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	SAP30	O75446	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	CLDN7	O95471	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	TSPAN13	O95857	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	TIMP1	P01033	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	NGFR	P08138	427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	ERG	P11308	486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	NPPB	P16860	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	TIMP3	P35625	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	DNASE1L1	P49184	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	PGF	P49763	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	LHX2	P50458	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	CRYBA4	P53673	196 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	MGAT2	Q10469	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	UNC119	Q13432	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	PDGFRL	Q15198	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	XP32	Q5T750	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	WDR82	Q6UXN9	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	SHISA5	Q8N114	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	LGI3	Q8N145	548 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	PPTC7	Q8NI37	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	PKIB	Q9C010	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	HHLA2	Q9UM44	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	TMEM131	Q92545	1883 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	SPTB	P11277	2137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GDPD3-205	ENST00000566613	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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