RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	CD28	P10747	220 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	INSL4	Q14641	139 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	SGCD	Q92629	289 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	THRSP	Q92748	146 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5M11	Q96RB7	305 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PTGES3L	E9PB15	166 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO24	O75426	580 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	MT-ND4	P03905	459 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	MNDA	P41218	407 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	IRF3	Q14653	427 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	LTC4S	Q16873	150 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	AWAT2	Q6E213	333 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	GAPT	Q8N292	157 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM104	Q8NE00	496 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		17.38	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		17.37	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	17.37	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35A2	P78381	396 aa		17.37	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	MADCAM1	Q13477	382 aa		17.37	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	17.37	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		17.37	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		17.37	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	MYDGF	Q969H8	173 aa		17.37	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	TOMM40L	Q969M1	308 aa		17.37	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	RPE	Q96AT9	228 aa		17.37	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		17.37	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PPI3	338 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	ORC5	O43913	435 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	OPN1MW	P04001	364 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	GNG10	P50151	68 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	LOXL3	P58215	753 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	SPHAR	Q15513	63 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC107	Q8WV48	283 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	BANF2	Q9H503	90 aa		17.36	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	SC5D	O75845	299 aa		17.35	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	MGMT	P16455	207 aa		17.35	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		17.35	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		17.35	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		17.35	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB12	Q6IQ22	244 aa		17.35	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	LYG1	Q8N1E2	194 aa		17.35	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	NEK7	Q8TDX7	302 aa		17.35	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL11	Q969Q4	196 aa		17.35	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	CYYR1	Q96J86	154 aa		17.35	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200		Q96M66	194 aa		17.35	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP21	Q9H596	190 aa		17.35	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	SCN3B	Q9NY72	215 aa		17.35	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PPE3	182 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	AIP	O00170	330 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PEX14	O75381	377 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM106CP	P0CH98	169 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	MYF6	P23409	242 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB7A	P51149	207 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR50	Q13585	617 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	DRAM1	Q8N682	238 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	OR56B4	Q8NH76	319 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	UBALD1	Q8TB05	177 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		17.34	■□□□□ 0.37
PPP4C-205	ENST00000563200		H0YHG0	523 aa		17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CD37	P11049	281 aa		17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	VHL	P40337	213 aa		17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8H3	Q8N146	312 aa		17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00311	Q8N616	119 aa		17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PHYHIP	Q92561	330 aa		17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TMED9	Q9BVK6	235 aa		17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	GHRL	Q9UBU3	117 aa		17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		17.33	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	C12orf77	C9JDV5	145 aa		17.32	■□□□□ 0.36

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