RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 OR8G1Q15617 311 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 RGS21Q2M5E4 152 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 PYDC2Q56P42 97 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 CASC10Q5T4H9 136 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 PLCXD3Q63HM9 321 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 MUC7Q8TAX7 377 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 TRIM63Q969Q1 353 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 GPER1Q99527 375 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 A6NLC8 198 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM210A6NLX4 147 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2E1P51965 193 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 TAS2R20P59543 309 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 GNG3P63215 75 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 MPPED2Q15777 294 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 ELP2Q6IA86 826 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 MOB3CQ70IA8 216 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF573Q86YE8 665 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 PNKDQ8N490 385 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 PIGCQ92535 297 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 FAM46BQ96A09 425 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 PKIBQ9C010 78 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 METTL9Q9H1A3 318 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.53□□□□□ -1.2
SMAD3-215ENST00000560424 RYR2Q92736 4967 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 LCE6AA0A183 80 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PQ09 198 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 H3BUI4 141 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFB3O43676 98 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 CA11O75493 328 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 KDM4BO94953 1096 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 GTF2F2P13984 249 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 MZT1Q08AG7 82 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 IL24Q13007 206 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 PLA2G7Q13093 441 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 DYRK1AQ13627 763 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 MICBQ29980 383 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 TRIQKQ629K1 86 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 MKXQ8IYA7 352 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 OR8H2Q8N162 312 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM104Q8NE00 496 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 AQP3Q92482 292 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 RFT1Q96AA3 541 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 Q96M66 194 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 SPACA5Q96QH8 159 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 S100A13Q99584 98 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 MICU1Q9BPX6 476 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.52□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms