RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557748.5

PGF-208, Transcript of placental growth factor, human

TSL 2

Gene PGF, Length 875 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGF-208	ENST00000557748	TPPP	O94811	219 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	FCGR3A	P08637	254 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	CD3G	P09693	182 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	ARF6	P62330	175 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	PITPNA	Q00169	270 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	CNIH2	Q6PI25	160 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	UPRT	Q96BW1	309 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	CALY	Q9NYX4	217 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	AUP1	Q9Y679	476 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	C15orf65	H3BRN8	121 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	SSX5	O60225	188 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	TOX4	O94842	621 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	AVP	P01185	164 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	HLA-DQB1	P01920	261 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	GZMH	P20718	246 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	DTYMK	P23919	212 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	SSTR5	P35346	364 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	TALDO1	P37837	337 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	GNG2	P59768	71 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	ARFRP1	Q13795	201 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	CCDC107	Q8WV48	283 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	TNFRSF14	Q92956	283 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	TBX15	Q96SF7	602 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748		Q9N2K0	584 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748		A0A1W2PPE2	198 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748		A0A1W2PR64	198 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748		A0A1W2PRV1	198 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	FSHB	P01225	129 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	PTHLH	P12272	177 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	PRTN3	P24158	256 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	TNFSF8	P32971	234 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	HMGN3	Q15651	99 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748		Q6ZS49	121 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	DTX3	Q8N9I9	347 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	F2RL2	O00254	374 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	MMP23A	O75900	390 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	S100A5	P33763	92 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	GDNF	P39905	211 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	ERVFRD-1	P60508	538 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	HLA-DRB3	P79483	266 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	CCDC190	Q86UF4	302 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	KIRREL1	Q96J84	757 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	SOST	Q9BQB4	213 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	RAB9B	Q9NP90	201 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748		A0A087X0M5	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748		A0A1B0GX30	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	SPINT2	O43291	252 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	HBZ	P02008	142 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	OMG	P23515	440 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	KIR2DS4	P43632	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	CBX5	P45973	191 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PGF-208	ENST00000557748	KIR2DS1	Q14954	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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