RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 C1QCP02747 245 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MARCH3Q86UD3 253 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR4D11Q8NGI4 311 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 VN1R1Q9GZP7 353 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RBKSQ9H477 322 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GLIPR2Q9H4G4 154 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFB11Q9NX14 153 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FUT9Q9Y231 359 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 KIF13BQ9NQT8 1826 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ARRDC5A6NEK1 342 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 COLCA2A8K830 154 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PATE3B3GLJ2 98 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CXCL13O43927 109 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CT45A6P0DMU7 189 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CT45A5P0DMU8 189 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CT45A7P0DMV0 189 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FCER1GP30273 86 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 P2RY1P47900 373 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MMP16P51512 607 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC10Q5BKY1 277 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ENTPD8Q5MY95 495 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF626Q68DY1 528 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf47Q8NEP4 570 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GHSRQ92847 366 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf44Q96CB5 159 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM56Q96MV1 263 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 NICN1Q9BSH3 213 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM38BQ9NVV0 291 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 V9GYH0 126 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CITO14578 2027 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR5B21A6NL26 309 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SIVA1O15304 175 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 NKX2-8O15522 239 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 VENTXO95231 258 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PGA4P0DJD7 388 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PGA5P0DJD9 388 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 AMY2BP19961 511 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ID1P41134 155 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01551Q86U37 167 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 UHRF2Q96PU4 802 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CEBPZOSA8MTT3 80 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 G3V2L1 256 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 C16orf97H3BN30 126 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ADRA2CP18825 462 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RPL27P61353 136 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MDGA2Q7Z553 956 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SYNPRQ8TBG9 265 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 EDARADDQ8WWZ3 215 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PTX4Q96A99 478 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GALMQ96C23 342 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD10Q9NXR5 420 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PIPOXQ9P0Z9 390 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 NTMQ9P121 344 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MYH10P35580 1976 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GWB2 263 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CTDSPLO15194 276 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TSPAN13O95857 204 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SP1P08047 785 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM13P0DJ93 91 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CXCL2P19875 107 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 HRH1P35367 487 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SELENOPP49908 381 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SLC37A1P57057 533 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SOX8P57073 446 aa5.54□□□□□ -1.52
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