RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 LILRB2Q8N423 598 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PLK3Q9H4B4 646 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MBD2Q9UBB5 411 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 HSF4Q9ULV5 492 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 AKAIN1P0CW23 69 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CHATP28329 748 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 Q8IYB0 196 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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THBS3-210ENST00000541576 SLC6A7Q99884 636 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 RHOFQ9HBH0 211 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 A0A1W2PR64 198 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 A0A1W2PRV1 198 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 A6NLC8 198 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ZG16O60844 167 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PDCD6O75340 191 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CA11O75493 328 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TFF3Q07654 80 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SPICQ8N5J4 248 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 RASL12Q9NYN1 266 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 VSTM5A8MXK1 200 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CD3EP07766 207 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PGA5P0DJD9 388 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PGAM2P15259 253 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FUT3P21217 361 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CD34P28906 385 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CD80P33681 288 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ADIPOQQ15848 244 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 STOML3Q8TAV4 291 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DCUN1D4Q92564 292 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ZFP57Q9NU63 452 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TMEM82A0PJX8 343 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR2A4O95047 310 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 RAB3DO95716 219 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CD74P04233 296 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR4A8P0C604 315 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DUSP1P28562 367 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CD200P41217 278 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MPPED2Q15777 294 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MPV17LQ2QL34 196 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR2A7Q96R45 310 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 A0A1B0GV90 55 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SHISA9B4DS77 424 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SPRY3O43610 288 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 NXPH2O95156 264 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CLDN14O95500 239 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ARG1P05089 322 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR4E1P0C645 316 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ZNF735P0CB33 412 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PI3P19957 117 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 RAG2P55895 527 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ERVK11-1P61568 191 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 IL13RA2Q14627 380 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.34□□□□□ -1.23
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