RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530565.5

CTSF-208, Transcript of cathepsin F, humanhuman

TSL 5

Gene CTSF, Length 555 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSF-208ENST00000530565 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.06□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.06□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 OPN4Q9UHM6 478 aa7.06□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 AUP1Q9Y679 476 aa7.06□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 FUOMA2VDF0 154 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 VGLL3A8MV65 326 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 RBBP9O75884 186 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 GLAP06280 429 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 GSTT2BP0CG30 244 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 ERP29P30040 261 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 KCNJ3P48549 501 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 VEGFCP49767 419 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 P2RX3P56373 397 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 ARF6P62330 175 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 IFITM3Q01628 133 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 AESQ08117 197 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 PLA2G7Q13093 441 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 RGS21Q2M5E4 152 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 TRIQKQ629K1 86 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 STEAP3Q658P3 488 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 BRICD5Q6PL45 260 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 COQ2Q96H96 371 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 NICN1Q9BSH3 213 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 SIRPDQ9H106 197 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 HSF4Q9ULV5 492 aa7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 A0A0A6YYD4 124 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 A0A1W2PPH5 198 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 hADV38S2A0JD32 116 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 POM121CA8CG34 1229 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 SERPINE3A8MV23 424 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 TCF21O43680 179 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 PDCD6O75340 191 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 TOX4O94842 621 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 MMP9P14780 707 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 CCL3L1P16619 93 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 HNF1AP20823 631 aa7.04□□□□□ -1.28
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CTSF-208ENST00000530565 INPP1P49441 399 aa7.04□□□□□ -1.28
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CTSF-208ENST00000530565 PAX5Q02548 391 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 ASAH1Q13510 395 aa7.04□□□□□ -1.28
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CTSF-208ENST00000530565 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
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CTSF-208ENST00000530565 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 CDNFQ49AH0 187 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 Q6ZTK2 550 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 TCF23Q7RTU1 214 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 TEX29Q8N6K0 151 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 NEK7Q8TDX7 302 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 GPX8Q8TED1 209 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.04□□□□□ -1.28
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CTSF-208ENST00000530565 RAB3CQ96E17 227 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 ING3Q9NXR8 418 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 KPTNQ9Y664 436 aa7.04□□□□□ -1.28
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CTSF-208ENST00000530565 TGP01266 2768 aa7.04□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.03□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.03□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.03□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 ODAMA1E959 279 aa7.03□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 CENPXA8MT69 81 aa7.03□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 M0R1W7 72 aa7.03□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 SOCS1O15524 211 aa7.03□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 ORC5O43913 435 aa7.03□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 PTTG1O95997 202 aa7.03□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 FSHBP01225 129 aa7.03□□□□□ -1.28
CTSF-208ENST00000530565 LPLP06858 475 aa7.03□□□□□ -1.28
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