RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529828.5

PTPRC-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 2,336 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-213ENST00000529828 MAGEA2P43356 314 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 RASSF2P50749 326 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 RIDAP52758 137 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 SLURP1P55000 103 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 RPP30P78346 268 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 APOFQ13790 326 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 UBE2V2Q15819 145 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 BCL2L15Q5TBC7 163 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 SLX4IPQ5VYV7 408 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 TMEM42Q69YG0 159 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 OR52W1Q6IF63 320 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 SLC25A24Q6NUK1 477 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 DEGS2Q6QHC5 323 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 IDO2Q6ZQW0 420 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 TPRA1Q86W33 373 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 OR2C3Q8N628 320 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 OR4D6Q8NGJ1 314 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 OR1N2Q8NGR9 330 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 OR14K1Q8NGZ2 314 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 C4orf3Q8WVX3 66 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 DCUN1D4Q92564 292 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 HRASLS5Q96KN8 279 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 APOL4Q9BPW4 351 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 FAM110AQ9BQ89 295 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 MROQ9BYG7 248 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 PKIBQ9C010 78 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 KLK15Q9H2R5 256 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 PLEKHA1Q9HB21 404 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 RHBDL2Q9NX52 303 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 V9GYS6 101 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 HERC1Q15751 4861 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 TRAV39A0A0B4J263 110 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 ODAMA1E959 279 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 ANKRD34BA5PLL1 514 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 M0R129 80 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 CCRL2O00421 344 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 LDLRAD4O15165 306 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 KRT36O76013 467 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 RPP14O95059 124 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 ZNF44P15621 663 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 ATP6V1B2P21281 511 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 VDAC1P21796 283 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 MYF6P23409 242 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 CD34P28906 385 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 PRRX1P54821 245 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 RAB4BP61018 213 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 FOXE3Q13461 319 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 GINS1Q14691 196 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 C17orf58Q2M2W7 97 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 TMEM236Q5W0B7 351 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 HACD2Q6Y1H2 254 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 MOB3BQ86TA1 216 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 ZNF679Q8IYX0 411 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 FAM58AQ8N1B3 248 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 OR10G2Q8NGC3 310 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 OR5D18Q8NGL1 313 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 RFESDQ8TAC1 157 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 UBALD1Q8TB05 177 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 CASTOR1Q8WTX7 329 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 ARPC1AQ92747 370 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 BORCS8Q96FH0 119 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 COQ2Q96H96 371 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 KIRREL1Q96J84 757 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 KCTD7Q96MP8 289 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 DGCR6LQ9BY27 220 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 KRT84Q9NSB2 600 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 NDE1Q9NXR1 346 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 OR52A1Q9UKL2 312 aa2.73□□□□□ -1.97
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PTPRC-213ENST00000529828 ZNF320A2RRD8 509 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 CCDC182A6NF36 153 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 OOSP1A8MZH6 123 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 F8W735 103 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 J3QR06 171 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 OVOL1O14753 267 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 HSD17B6O14756 317 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 PRODHO43272 600 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 IGHG4P01861 327 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 ELANEP08246 267 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 OR8U8P0C7N1 319 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-213ENST00000529828 SLC2A5P22732 501 aa2.73□□□□□ -1.97
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