RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.38□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 SEMA4FO95754 770 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 EML2O95834 649 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 C1QTNF9P0C862 333 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 LHX2P50458 406 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 PSG4Q00888 419 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ARL16Q0P5N6 197 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 HYAL1Q12794 435 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF266Q14584 549 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 GNMTQ14749 295 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 OR8G5Q8NG78 346 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF596Q8TC21 504 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM56Q96MV1 263 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 SLC46A1Q96NT5 459 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 DERL1Q9BUN8 251 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 FAM206AQ9NX38 181 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 SERINC4A6NH21 518 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 DIRC3C9JPN6 131 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 GYPAP02724 150 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 SERPINA7P05543 415 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 AADACP22760 399 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 TSPOP30536 169 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 BLKP51451 505 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 PAX9P55771 341 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 RELBQ01201 579 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 WBP2NLQ6ICG8 309 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 Q6ZPA2 131 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 COMMD2Q86X83 199 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 OVCA2Q8WZ82 227 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.37□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 NOTCH4Q99466 2003 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 CHST1O43916 411 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF737O75373 536 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ISG15P05161 165 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 FAHP16930 419 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 WASP42768 502 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 HLA-BQ31612 363 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 BATF2Q8N1L9 274 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 STARD4Q96DR4 205 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 RCHY1Q96PM5 261 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 GPER1Q99527 375 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 OR10A2Q9H208 303 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 SERGEFQ9UGK8 458 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 GPR34Q9UPC5 381 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ADAM20O43506 726 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 PVRP15151 417 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF20P17024 532 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 FOXE3Q13461 319 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 FIGLAQ6QHK4 219 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 FAM3CQ92520 227 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 OBSL1O75147 1896 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 CYR61O00622 381 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 KBTBD11O94819 623 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 TYMSP04818 313 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF728P0DKX0 622 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 CT45A8P0DMV1 189 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 CT45A9P0DMV2 189 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 IL12BP29460 328 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 CAPZBP47756 277 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 TAS2R46P59540 309 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 MSMO1Q15800 293 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 CT45A2Q5DJT8 189 aa7.36□□□□□ -1.23
VWA3B-220ENST00000495571 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.3 ms