RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491490.5

RHBDD1-213, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RHBDD1, Length 801 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-213ENST00000491490 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.41□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.41□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 EHFQ9NZC4 300 aa6.41□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.41□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.41□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 MIOXQ9UGB7 285 aa6.41□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 VPS13CQ709C8 3753 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 POM121CA8CG34 1229 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 C22orf46C9J442 243 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 C12orf77C9JDV5 145 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 H7C1Q1 480 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 SULT1C2O00338 296 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 FABP7O15540 132 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 HSPA12AO43301 675 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 NDUFA2O43678 99 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 RAB3DO95716 219 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 NAPSAO96009 420 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 IFNA6P05013 189 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 MELTFP08582 738 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 DTYMKP23919 212 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 GIFP27352 417 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 CBX5P45973 191 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 OR3A3P47888 321 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 RFX2P48378 723 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 KCNJ3P48549 501 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 GNG10P50151 68 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 CCR6P51684 374 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 TAS2R19P59542 299 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 FXYD4P59646 89 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 TSPAN5P62079 268 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 GNMTQ14749 295 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 TCF23Q7RTU1 214 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 HOGA1Q86XE5 327 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 ARL11Q969Q4 196 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 RAB39BQ96DA2 213 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 GINS4Q9BRT9 223 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 Q9N2K0 584 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.4□□□□□ -1.38
RHBDD1-213ENST00000491490 SPG11Q96JI7 2443 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 hADV38S2A0JD32 116 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 FUOMA2VDF0 154 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 CENPXA8MT69 81 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 TRDCB7Z8K6 153 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 FAM157AC9JC47 383 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 NDUFS8O00217 210 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 LYRM1O43325 122 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 HBZP02008 142 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 GLAP06280 429 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 WNT2P09544 360 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 AKAIN1P0CW23 69 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 COX7A1P24310 79 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 TAS2R46P59540 309 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 DEFA1P59665 94 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 DEFA3P59666 94 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 AP3S2P59780 193 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 HERPUD1Q15011 391 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 C6orf183Q5T699 404 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 SHEQ5VZ18 495 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 TMEM17Q86X19 198 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 ENKURQ8TC29 256 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 TOMM40LQ969M1 308 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 ZNF714Q96N38 554 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 CALYQ9NYX4 217 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 GNG12Q9UBI6 72 aa6.39□□□□□ -1.39
RHBDD1-213ENST00000491490 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms