RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 MED30Q96HR3 178 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 LURAP1Q96LR2 239 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 CCL13Q99616 98 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM246Q9BRR3 403 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 GHITMQ9H3K2 345 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 CHODLQ9H9P2 273 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 CTSZQ9UBR2 303 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 DUX4Q9UBX2 424 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF221Q9UK13 617 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 VSIG4Q9Y279 399 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 MEIKINA0A087WXM9 373 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 OR5H14A6NHG9 310 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 C12orf77C9JDV5 145 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 C15orf65H3BRN8 121 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 FCN3O75636 299 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 CGB3P0DN86 165 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 CGB7P0DN87 165 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 DAOP14920 347 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 CDKN1AP38936 164 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 EFNA4P52798 201 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 UCP3P55916 312 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 TSPAN5P62079 268 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 TCF23Q7RTU1 214 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 OR13A1Q8NGR1 328 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 FAHD2AQ96GK7 314 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 TAF9BQ9HBM6 251 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 GPR132Q9UNW8 380 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 ALG5Q9Y673 324 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 A1L4Q6 167 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 LYNX1G3V0Z9 82 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 TMPRSS2O15393 492 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 PPYP01298 95 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 LYNX1P0DP58 116 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 PAX1P15863 534 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 FCGR2CP31995 323 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 EDDM3AQ14507 147 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 METTL11BQ5VVY1 283 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 TPRX1Q8N7U7 411 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 MARCH1Q8TCQ1 289 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 MRGPRDQ8TDS7 321 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 CCDC107Q8WV48 283 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 CORO2AQ92828 525 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 KIRREL1Q96J84 757 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 OR6C3Q9NZP0 311 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 LRRK2Q5S007 2527 aa9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-220ENST00000489318 A0A0A6YYJ9 748 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 TRAV39A0A0B4J263 110 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 SNRPGP15A8MWD9 76 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 F2RL2O00254 374 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ADAM20O43506 726 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 LY6HO94772 140 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 HBZP02008 142 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 HEXAP06865 529 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 VSIG10L2P0DP72 767 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 GZMHP20718 246 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 SSTR5P35346 364 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 NPY4RP50391 375 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM33P57088 247 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 RAB25P57735 213 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 TAS2R31P59538 309 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 HTD2P86397 168 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 DHODHQ02127 395 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM30BQ3MIR4 351 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF626Q68DY1 528 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 C5orf24Q7Z6I8 188 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 FAM216AQ8WUB2 273 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 RAB1CQ92928 201 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM230Q96A57 120 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 TIMD4Q96H15 378 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 CCL19Q99731 98 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ING3Q9NXR8 418 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00312Q9Y6C7 94 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 F5H0A9 414 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms