RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 ZNF732B4DXR9 585 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 NPIPB4C9JG80 1138 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 IGHG1P01857 330 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 GALR1P47211 349 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 THEM4Q5T1C6 240 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 CST9LP1Q5W188 147 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 LRTM2Q8N967 370 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 RPRMQ9NS64 109 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 AADACP22760 399 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 GNB2P62879 340 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 RTP5Q14D33 572 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 PRSS8Q16651 343 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A26Q70HW3 274 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 OR5L2Q8NGL0 311 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 SCGB1C1Q8TD33 95 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 NAT6Q93015 286 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 R3HDM4Q96D70 268 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 DEFB126Q9BYW3 111 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 DECR2Q9NUI1 292 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 P4HTMQ9NXG6 502 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 MPPED1O15442 326 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 TMEM50AO95807 157 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 WNT5AP41221 380 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 TAS2R30P59541 319 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 RPS18P62269 152 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 PHYHD1Q5SRE7 291 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 SPIN2AQ99865 258 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 CDS2O95674 445 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 GZMHP20718 246 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 TESK1Q15569 626 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A53Q5H9E4 307 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 TM2D1Q9BX74 207 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 CTDSP1Q9GZU7 261 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 VSIRQ9H7M9 311 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 PRSS50Q9UI38 385 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 TRDCB7Z8K6 153 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 DKK1O94907 266 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 CD33P20138 364 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 CLDN17P56750 224 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 SAP25Q8TEE9 199 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 LYZL4Q96KX0 146 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 Q96M66 194 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 ZNF286AQ9HBT8 521 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 WNT16Q9UBV4 365 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 METTL15P1P0C7V9 234 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 TMEM241Q24JQ0 296 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 HLA-BQ31612 363 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 ATP5SQ99766 215 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 BSXQ3C1V8 233 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 PIGYQ3MUY2 71 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 ZNF774Q6NX45 483 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 SDSLQ96GA7 329 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 UCN2Q96RP3 112 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 RBKSQ9H477 322 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 ZNF442Q9H7R0 627 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 DCAF10Q5QP82 559 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 LYSMD4Q5XG99 296 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D26Q86UD7 250 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 ACY3Q96HD9 319 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 PLK3Q9H4B4 646 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 DHRS3O75911 302 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 PFN1P07737 140 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 CCL3P10147 92 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 MSX1P28360 303 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 CCKARP32238 428 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 GNG10P50151 68 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 OR5I1Q13606 314 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 PCOLCEQ15113 449 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 RAB35Q15286 201 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 CRIP3Q6Q6R5 217 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 SSC4DQ8WTU2 575 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 IL22RA2Q969J5 263 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 MS4A10Q96PG2 267 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 TBX15Q96SF7 602 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 TMEM222Q9H0R3 208 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 PLA2G3Q9NZ20 509 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
NISCH-212ENST00000488380 PPYP01298 95 aa11.58□□□□□ -0.56
NISCH-212ENST00000488380 C1orf194Q5T5A4 169 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms