RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP54-210ENST00000466048 PP6455Q8WZ26 134 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 MCHR2Q969V1 340 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 CHST6Q9GZX3 395 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 C5orf49A4QMS7 147 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 ZNF524Q96C55 264 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 IL11P20809 199 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 C10orf128Q5T292 105 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.67□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 ZIC3O60481 467 aa6.67□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 C10orf35Q96D05 121 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ORAI1Q96D31 301 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 POM121Q96HA1 1249 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.67□□□□□ -1.34
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