RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM189A2Q15884 450 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 CDNFQ49AH0 187 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 TCF23Q7RTU1 214 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4K15Q8NH41 348 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 MCFD2Q8NI22 146 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 PHF21AQ96BD5 680 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 ABCG5Q9H222 651 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 HSF4Q9ULV5 492 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A0G2JMP0 313 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A0X1KG70 313 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 FUOMA2VDF0 154 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 MFNGO00587 321 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 RGS5O15539 181 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 LIPFP07098 398 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 PTHLHP12272 177 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 GLP1RP43220 463 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNJ3P48549 501 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 DLX1P56177 255 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 PAX8Q06710 450 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4M2Q8NGB6 313 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 UBALD1Q8TB05 177 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 SETD6Q8TBK2 473 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 CMTM3Q96MX0 182 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 DIABLOQ9NR28 239 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 BATF3Q9NR55 127 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM235A6NFC5 223 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 XRCC3O43542 346 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 MMP23AO75900 390 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 SCGNO76038 276 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 TOX4O94842 621 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 APOA1P02647 267 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 CD3GP09693 182 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF728P0DKX0 622 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 DLX6P56179 175 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 TAS2R20P59543 309 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 ARFRP1Q13795 201 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF124Q15973 351 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 LTC4SQ16873 150 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 CR1LQ2VPA4 569 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 Q6ZPA2 131 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 LAX1Q8IWV1 398 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 Q8N7P7 452 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 RFESDQ8TAC1 157 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 CORO2AQ92828 525 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF714Q96N38 554 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 WDFY2Q96P53 400 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 TBX15Q96SF7 602 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 SIRPDQ9H106 197 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 OPN4Q9UHM6 478 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 AUP1Q9Y679 476 aa6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms