RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN9O75954 239 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 MPIG6BO95866 241 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 PAHP00439 452 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 GTF2F2P13984 249 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 MGMTP16455 207 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 NFYBP25208 207 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 HTR2CP28335 458 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPA13P48723 471 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 LGALS4P56470 323 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 CLDN12P56749 244 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10A3P58181 314 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 PAX5Q02548 391 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 MPV17LQ2QL34 196 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 HSD17B12Q53GQ0 312 aa5.63□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR4K15Q8NH41 348 aa5.63□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLITRK2Q9H156 845 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 C16orf95Q9H693 158 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 TCF7L1Q9HCS4 588 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6C3Q9NZP0 311 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 CKLFQ9UBR5 152 aa5.63□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 RNF114Q9Y508 228 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0B4J203 849 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PPE2 198 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PR64 198 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PRV1 198 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 FUOMA2VDF0 154 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 VGLL3A8MV65 326 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM90A22PA8MWA6 464 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 J3QR06 171 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A1O15245 554 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 SOCS1O15524 211 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 IL1AP01583 271 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 CRYBA1P05813 215 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 GABRA5P31644 462 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM50BP56557 158 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 LOXL3P58215 753 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 BLCAPP62952 87 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 P2RY14Q15391 338 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 HLA-DRB5Q30154 266 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 C6orf201Q7Z4U5 140 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00596Q86U02 117 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 GAPTQ8N292 157 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 OR51D1Q8NGF3 324 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1L1Q8NH94 360 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 NDNFQ8TB73 568 aa5.62□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 S100A13Q99584 98 aa5.62□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 SULT4A1Q9BR01 284 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 TM2D1Q9BX74 207 aa5.62□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 RNF167Q9H6Y7 350 aa5.62□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 FAM90A16PA6NEW6 464 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 FAM90A12PA8MX19 464 aa5.61□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 C12orf77C9JDV5 145 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 MCRIP1C9JLW8 97 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC17A2O00624 439 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 LDLRAD4O15165 306 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 AMY1AP04745 511 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 AMY2AP04746 511 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM90A15PP0C7V4 464 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM90A13PP0C7W8 464 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM90A14PP0C7W9 464 aa5.61□□□□□ -1.51
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