RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 PNPLA4P41247 253 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PLA2G4AP47712 749 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GDI2P50395 445 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SSR4P51571 173 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 STX17P56962 302 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 KIAA1024LP59773 190 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CDC42P60953 191 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RPL32P62910 135 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RPS21P63220 83 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RHOGP84095 191 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SLC7A5Q01650 507 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MC1RQ01726 317 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GAGE4Q13068 117 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PICALMQ13492 652 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 APOFQ13790 326 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RASA2Q15283 850 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SNCBQ16143 134 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 DEFB114Q30KQ6 69 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GALNTL6Q49A17 601 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CPTPQ5TA50 214 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 C1orf146Q5VVC0 180 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SLFN13Q68D06 897 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR52E8Q6IFG1 317 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 DEGS2Q6QHC5 323 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM107Q6UX40 140 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 COPS6Q7L5N1 327 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NIPA1Q7RTP0 329 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 VN1R4Q7Z5H5 301 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OFCC1Q8IZS5 231 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TBC1D19Q8N5T2 526 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 YIPF7Q8N8F6 280 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR11H7Q8NGC8 314 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR6K6Q8NGW6 343 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR10R2Q8NGX6 335 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR6K2Q8NGY2 324 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR8K5Q8NH50 307 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RAET1EQ8TD07 263 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TSLPQ969D9 159 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TOMM40LQ969M1 308 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OPTNQ96CV9 577 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR10C1Q96KK4 312 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 FAM167BQ9BTA0 163 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RTL8AQ9BWD3 113 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 STK31Q9BXU1 1019 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 LRRC3Q9BY71 257 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ULBP3Q9BZM4 244 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR2B2Q9GZK3 357 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SLC38A1Q9H2H9 487 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RIBC2Q9H4K1 309 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 C10orf88Q9H8K7 445 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CALHM2Q9HA72 323 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NECTIN3Q9NQS3 549 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ANO10Q9NW15 660 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GDE1Q9NZC3 331 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GPR160Q9UJ42 338 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MAFFQ9ULX9 164 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RNF24Q9Y225 148 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PIK3C2GO75747 1445 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ABCC9O60706 1549 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ATP7AQ04656 1500 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 A0A088AWK7 358 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM189A5PLL7 270 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR6C65A6NJZ3 312 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 J3QRK9 145 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TOR1BO14657 336 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 INPP4BO15327 924 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 STX7O15400 261 aaKnown RBP-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 XRCC2O43543 280 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 DENRO43583 198 aaKnown RBP-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ZBTB14O43829 449 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RAMP1O60894 148 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 IFNB1P01574 187 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ALBP02768 609 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ATP1B1P05026 303 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 IQCF3P0C7M6 154 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ADORA3P0DMS8 318 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM225BP0DP42 221 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GFAPP14136 432 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 IDO1P14902 403 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 DAOP14920 347 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PMCHP20382 165 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CCND1P24385 295 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ACP1P24666 158 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CD82P27701 267 aa-2.64□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms