RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 MPV17LQ2QL34 196 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 OR56B4Q8NH76 319 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 CAPSLQ8WWF8 208 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 FAM46BQ96A09 425 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 RPEQ96AT9 228 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 OCSTAMPQ9BR26 566 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 MND1Q9BWT6 205 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 WNT10AQ9GZT5 417 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PPI3 338 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 C15orf65H3BRN8 121 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 AIPO00170 330 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 CD1AP06126 327 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 LPLP06858 475 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 MGMTP16455 207 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 REG1BP48304 166 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 MED22Q15528 200 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 ACSM3Q53FZ2 586 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 C9orf152Q5JTZ5 239 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 C10orf99Q6UWK7 81 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 C5orf24Q7Z6I8 188 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 LINC00596Q86U02 117 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 DRAM1Q8N682 238 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 OR4K15Q8NH41 348 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 ARL11Q969Q4 196 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 SELENOIQ9C0D9 397 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 LINC00574Q9H8X3 128 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 LIN7BQ9HAP6 207 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PRX2 142 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 UBE2QL1A1L167 161 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 OR2F2O95006 317 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 MNDAP41218 407 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 ARHGDIBP52566 201 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 HNF4GQ14541 408 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 SIGIRRQ6IA17 410 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 OR10K2Q6IF99 312 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 RAB12Q6IQ22 244 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 ZNF497Q6ZNH5 498 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 C16orf82Q7Z2V1 217 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 PRR18Q8N4B5 295 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 OR10X1Q8NGY0 326 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 MYDGFQ969H8 173 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 CREB3L1Q96BA8 519 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 ETAA1Q9NY74 926 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
PRAME-209ENST00000439106 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 C12orf77C9JDV5 145 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 G3V4G9 280 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 HSD17B6O14756 317 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 SLC31A2O15432 143 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 MT-ND4P03905 459 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 LOXL3P58215 753 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 SLC35A2P78381 396 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 MADCAM1Q13477 382 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 GPR50Q13585 617 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 GPR176Q14439 515 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 HES1Q14469 280 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 IRF3Q14653 427 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 SPHARQ15513 63 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 LIPKQ5VXJ0 399 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 NKAIN3Q8N8D7 197 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 OR10V1Q8NGI7 309 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 TMEM203Q969S6 136 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 AKR1E2Q96JD6 320 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 Q96M66 194 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 SCN3BQ9NY72 215 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 PEX16Q9Y5Y5 336 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 FAM90A18PA6NE21 464 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 FAM90A16PA6NEW6 464 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 FAM90A12PA8MX19 464 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 OOSP1A8MZH6 123 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 MCRIP1C9JLW8 97 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 MPIG6BO95866 241 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 IGKV1D-33P01593 117 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 IGKV1-33P01594 117 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 FAM90A15PP0C7V4 464 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 FAM90A13PP0C7W8 464 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 FAM90A14PP0C7W9 464 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 FAM90A24PP0C7X0 464 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 HSMCR30P0CW71 290 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms