RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 PECRQ9BY49 303 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 LIPGQ9Y5X9 500 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 UBE2CO00762 179 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 SPRY3O43610 288 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 CYC1P08574 325 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 CT45A6P0DMU7 189 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 CT45A5P0DMU8 189 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 CT45A7P0DMV0 189 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 MAGEA5P43359 124 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ZP4Q12836 540 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 CT45A1Q5HYN5 189 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 C12orf54Q6X4T0 127 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 CT45A3Q8NHU0 189 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ABHD3Q8WU67 409 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 MSL2Q9HCI7 577 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 TAAR3PQ9P1P4 343 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 A0A0B4J293 547 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 M0R2Z0 102 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 HERPUD1Q15011 391 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 FAM78BQ5VT40 261 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ATRAIDQ6UW56 229 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 GDF15Q99988 308 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 COA4Q9NYJ1 87 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 SEMA7AO75326 666 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 CNIH1O95406 144 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 VSIG8P0DPA2 414 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 DEFA4P12838 97 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 OR10AD1Q8NGE0 317 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 BLNKQ8WV28 456 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ERGIC1Q969X5 290 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 SLC35E1Q96K37 410 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 TAAR6Q96RI8 345 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ANGPTL4Q9BY76 406 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 PRSS50Q9UI38 385 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF236Q9UL36 1845 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 HOXA5P20719 270 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 KIR3DL2P43630 455 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF83P51522 516 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 EFNB2P52799 333 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 CRYBA2P53672 197 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 GFRALQ6UXV0 394 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 RPS4Y2Q8TD47 263 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 NAA60Q9H7X0 242 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ANXA10Q9UJ72 324 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 SPTBN2O15020 2390 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 NDUFA2O43678 99 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 PGA3P0DJD8 388 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ZBTB25P24278 435 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 BTNL3Q6UXE8 466 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 COMMD5Q9GZQ3 224 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ICE1Q9Y2F5 2266 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 SEC11BP0C7V7 166 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 PPOXP50336 477 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 STARD6P59095 220 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 TMEM251Q8N6I4 163 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ABCA7Q8IZY2 2146 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 FOXC1Q12948 553 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 NUDT11Q96G61 164 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 PATJQ8NI35 1801 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 TSPAN7P41732 249 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 SOX8P57073 446 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 MGAT2Q10469 447 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 C3AR1Q16581 482 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 HLA-DRB5Q30154 266 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 DCAF10Q5QP82 559 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 RFESDQ8TAC1 157 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 SOX7Q9BT81 388 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 GPR35Q9HC97 309 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 ACTL6AO96019 429 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 IL11P20809 199 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 CEACAM6P40199 344 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 DMWDQ09019 674 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-204ENST00000368210 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms