RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 HSPA12AO43301 675 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 GSTT2P0CG29 244 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP10-9P60411 292 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 RPL31P62899 125 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 DEFB113Q30KQ7 82 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 VAX1Q5SQQ9 334 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 FAAP20Q6NZ36 180 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF554Q86TJ5 538 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 FAM185AQ8N0U4 392 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 GAPTQ8N292 157 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ARRDC1Q8N5I2 433 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 OR56B4Q8NH76 319 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 OR10J5Q8NHC4 309 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 IL1F10Q8WWZ1 152 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 NINJ1Q92982 152 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ARL11Q969Q4 196 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 GALMQ96C23 342 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 TAF9BQ9HBM6 251 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 COPZ2Q9P299 210 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 DIRAS3O95661 229 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 WNT2P09544 360 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SCTP09683 121 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 OR5H8P0DN80 308 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 RFX2P48378 723 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 HERV-K104P61576 105 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 HMGN3Q15651 99 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 CLEC12BQ2HXU8 276 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 PLET1Q6UQ28 207 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 OR4D10Q8NGI6 311 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 OR51S1Q8NGJ8 323 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 OR13A1Q8NGR1 328 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 OR6F1Q8NGZ6 308 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 C10orf105Q8TEF2 133 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 TAS2R3Q9NYW6 316 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 OPN4Q9UHM6 478 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00312Q9Y6C7 94 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ICE1Q9Y2F5 2266 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A16P16260 332 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ZBTB25P24278 435 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ECI1P42126 302 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 CD276Q5ZPR3 534 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 OVCH2Q7RTZ1 564 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 NRARPQ7Z6K4 114 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 CLDND2Q8NHS1 167 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 KIRREL1Q96J84 757 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF714Q96N38 554 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SCGB3A2Q96PL1 93 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 CALYQ9NYX4 217 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF69Q9UC07 566 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SLC23A1Q9UHI7 598 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 PLCE1Q9P212 2302 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PPE2 198 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PR64 198 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PRV1 198 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 FAM172BPA6NC97 362 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 C12orf77C9JDV5 145 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 F5H0A9 414 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV2-5P01817 119 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 HBZP02008 142 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 PGAM2P15259 253 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 FCGR2CP31995 323 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SSTR5P35346 364 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 CCR6P51684 374 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 LTC4SQ16873 150 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM30BQ3MIR4 351 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 IGSF11Q5DX21 431 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZPA2 131 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 IDO2Q6ZQW0 420 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 BTN2A1Q7KYR7 527 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 CENPSQ8N2Z9 138 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 FGFRL1Q8N441 504 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 CORO2AQ92828 525 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 MBD6Q96DN6 1003 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SLC6A7Q99884 636 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 DCTN5Q9BTE1 182 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 CABLES2Q9BTV7 478 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 PTPN13Q12923 2485 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms