RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361115.4

CCL28-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL28, Length 3,126 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-201ENST00000361115 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 BTG2P78543 158 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 SLC10A1Q14973 349 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 VSTM2LQ96N03 204 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 C19orf84I3L1E1 186 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 GUSBP08236 651 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 NPSP0C0P6 89 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 HSD11B1P28845 292 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 OR52N5Q8NH56 324 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 EHFQ9NZC4 300 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 PRSS37A4D1T9 235 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 A8MVM7 634 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 XKRYO14609 159 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 ZFAND5O76080 213 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 OR4A8P0C604 315 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 FUT3P21217 361 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 OR3A2P47893 321 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 MMP16P51512 607 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 RAB38P57729 211 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 ZNF117Q03924 483 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 SLAQ13239 276 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 ICAM4Q14773 271 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 CA13Q8N1Q1 262 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 LFNGQ8NES3 379 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 TVP23CQ96ET8 276 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 LYRM4Q9HD34 91 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 C17orf51A8MQB3 221 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 ISG15P05161 165 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 CT45A8P0DMV1 189 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 CT45A9P0DMV2 189 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 RBX1P62877 108 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 ACKR1Q16570 336 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 E5RGE8 158 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 GPR137BO60478 399 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 PGA3P0DJD8 388 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 PNMTP11086 282 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 ARFRP1Q13795 201 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 REEP6Q96HR9 211 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 NSG2Q9Y328 171 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 LAMA1P25391 3075 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 IFNL4K9M1U5 179 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 CHRM2P08172 466 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL28-201ENST00000361115 GLI4P10075 376 aa6.62□□□□□ -1.35
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