RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302273.2

VPREB1-201, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene VPREB1, Length 626 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1-201ENST00000302273 CGB7P0DN87 165 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 ERVFRD-1P60508 538 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 AESQ08117 197 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 CD300CQ08708 224 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 IL18Q14116 193 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 OR10K2Q6IF99 312 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 Q6ZS49 121 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 Q8N402 240 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 NEK7Q8TDX7 302 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 CREB3L1Q96BA8 519 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 COQ2Q96H96 371 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 SIRPDQ9H106 197 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 PPA2Q9H2U2 334 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 METRNQ9UJH8 293 aa7.29□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 A0A1B0GW55 424 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 TOX4O94842 621 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 PAHP00439 452 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 MMP9P14780 707 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 TALDO1P37837 337 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 MNDAP41218 407 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 KIR2DS4P43632 304 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 VEGFCP49767 419 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 TMEM50BP56557 158 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 MADCAM1Q13477 382 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 KIR2DS1Q14954 304 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 HACD4Q5VWC8 232 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 AKAP14Q86UN6 197 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 BATF2Q8N1L9 274 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 OR5H6Q8NGV6 325 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 LGALS14Q8TCE9 139 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 TNFRSF14Q92956 283 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 CHST6Q9GZX3 395 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 GHITMQ9H3K2 345 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 DUX4Q9UBX2 424 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.28□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.27□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 NAV3Q8IVL0 2385 aa7.27□□□□□ -1.24
VPREB1-201ENST00000302273 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MFNGO00587 321 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SOCS1O15524 211 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SPINT2O43291 252 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CTXN2P0C2S0 81 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SELLP14151 372 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 DTYMKP23919 212 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CD34P28906 385 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 GLP1RP43220 463 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CBX5P45973 191 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 GLIPR1P48060 266 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 UBE2E1P51965 193 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 DLX6P56179 175 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ARF6P62330 175 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 HTD2P86397 168 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 EDDM3AQ14507 147 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.27□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MIDNQ504T8 468 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms