RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296503.9

HMGB2-201, Transcript of high mobility group box 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGB2, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2-201ENST00000296503 GPR148Q8TDV2 347 aa10.01□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 SLAMF9Q96A28 289 aa10.01□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 GAFA1Q96PS6 74 aa10.01□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 OR14J1Q9UGF5 321 aa10.01□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 GPR37O15354 613 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 ARL6IP5O75915 188 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 ALDOBP05062 364 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 CD2P06729 351 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 CD3GP09693 182 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 SELLP14151 372 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 FPR2P25090 351 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 PRDX2P32119 198 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 CAPZA1P52907 286 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 DGCR2P98153 550 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 UBE2NLQ5JXB2 153 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 TMUB2Q71RG4 321 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 OR1S1Q8NH92 325 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 SPSB1Q96BD6 273 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 SPACA5Q96QH8 159 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 NRIP2Q9BQI9 281 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 CNTD2Q9H8S5 307 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 HRASLSQ9HDD0 168 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 MTCH1Q9NZJ7 389 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 ZNF281Q9Y2X9 895 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 MXRA5Q9NR99 2828 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 H3BUI4 141 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 SIGLEC5O15389 551 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 FCN3O75636 299 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 HCKP08631 526 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 GDNFP39905 211 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 CCR6P51684 374 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 FGF12P61328 243 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 ARF6P62330 175 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 ZNRF1Q8ND25 227 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 TMEM185AQ8NFB2 350 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 C22orf15Q8WYQ4 148 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 GHSRQ92847 366 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 SMIM19Q96E16 107 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 CXorf58Q96LI9 332 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 PCGF1Q9BSM1 259 aa10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 ZNF879B4DU55 563 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 TCF21O43680 179 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 PPIAL4GP0DN37 164 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 RPA2P15927 270 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 ERVK11-1P61568 191 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 Q6ZTK2 550 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 CEACAM19Q7Z692 300 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 TMEM17Q86X19 198 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 BPIFB2Q8N4F0 458 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 CD177Q8N6Q3 437 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 SDSLQ96GA7 329 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 PGLYRP3Q96LB9 341 aa9.99□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 F8VVB4 439 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 F8VWA3 439 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 TEX46H3BTG2 121 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 TOX4O94842 621 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 NDUFB6O95139 128 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 KNG1P01042 644 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 UCHL1P09936 223 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 SCAND1P57086 179 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 PDZK1IP1Q13113 114 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 INSL4Q14641 139 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 LIN54Q6MZP7 749 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 RPS4Y2Q8TD47 263 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 TMEM106AQ96A25 262 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 DCTN5Q9BTE1 182 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 HES4Q9HCC6 221 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 ONECUT1Q9UBC0 465 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 H7C2Y5 167 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 ANGPTL7O43827 346 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 FSHBP01225 129 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 MT-ND4P03905 459 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 IFNA4P05014 189 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 UBBP0CG47 229 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 TMEM225BP0DP42 221 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 CALCBP10092 127 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 BCL3P20749 454 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 NPBWR2P48146 333 aa9.98□□□□□ -0.81
HMGB2-201ENST00000296503 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms