RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	GPR35	Q9HC97	309 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	PARP11	Q9NR21	331 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CACNA1B	Q00975	2339 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A0U1RQV5	110 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ARGFX	A6NJG6	315 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	FABP4	P15090	132 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	RAB4B	P61018	213 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	SRD5A2	P31213	254 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CCL11	P51671	97 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	IL11RA	Q14626	422 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	OR4F5	Q8NH21	305 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ADGRG7	Q96K78	797 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	OR4F4	Q96R69	305 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525		H3BQ15	152 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	DFFB	O76075	338 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	P2RY1	P47900	373 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TGFBR3	Q03167	851 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	IL13RA2	Q14627	380 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CLDN23	Q96B33	292 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC25A22	Q9H936	323 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	LYZL6	O75951	148 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	PSG2	P11465	335 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CEACAM6	P40199	344 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	DLK1	P80370	383 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	PCOLCE	Q15113	449 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CARF	Q8N187	725 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TCFL5	Q9UL49	500 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	HSF4	Q9ULV5	492 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CDIPT	O14735	213 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	PHOX2A	O14813	284 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	OR1C1	Q15619	314 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	THADA	Q6YHU6	1953 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525		C9JQL5	133 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ZIC3	O60481	467 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	DHRS13	Q6UX07	377 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	S100A8	P05109	93 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	BATF	Q16520	125 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF573	Q86YE8	665 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TVP23C	Q96ET8	276 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CELA3A	P09093	270 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	VDAC1	P21796	283 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	GCH1	P30793	250 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM3A	P98173	230 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ENY2	Q9NPA8	101 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	SEC11B	P0C7V7	166 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM187	Q14656	261 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC10A1	Q14973	349 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525		H7BYZ3	331 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	IGLV3-19	P01714	112 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	QRFP	P83859	136 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	OR8G1	Q15617	311 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	RAB39B	Q96DA2	213 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SPIN3-223	ENST00000639525	CST2	P09228	141 aa		10.16	□□□□□ -0.78

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