RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635853.1

SPTAN1-228, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 5,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-228ENST00000635853 LYZL6O75951 148 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 PEX11BO96011 259 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 HKR1P10072 659 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 CA6P23280 308 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 CD40P25942 277 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 FZD5Q13467 585 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 Q5PR19 223 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 DCAF10Q5QP82 559 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 OR13G1Q8NGZ3 307 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 LRRC61Q9BV99 259 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 FCN1O00602 326 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 NGFP01138 241 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 PMELP40967 661 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 ELOBQ15370 118 aa8.7□□□□□ -1.02
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SPTAN1-228ENST00000635853 A0A1W2PR48 441 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 PRRT4C9JH25 899 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.7□□□□□ -1.02
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SPTAN1-228ENST00000635853 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 VWA1Q6PCB0 445 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 MUC15Q8N387 334 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SLX4Q8IY92 1834 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 C3orf80F5H4A9 247 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 OR5AL1P0C617 328 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 MANBALQ9NQG1 85 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 IL36GQ9NZH8 169 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 A6NDN8 102 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SOX8P57073 446 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 ISXQ2M1V0 245 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 OR52N4Q8NGI2 321 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 RNF2Q99496 336 aa8.7□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 BMPR1BO00238 502 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 TNFSF14O43557 240 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 BSGP35613 385 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 NUBP1P53384 320 aa8.69□□□□□ -1.02
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SPTAN1-228ENST00000635853 Q6ZS52 159 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.69□□□□□ -1.02
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SPTAN1-228ENST00000635853 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.69□□□□□ -1.02
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SPTAN1-228ENST00000635853 KCNMB1Q16558 191 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 OR2C3Q8N628 320 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 VN1R1Q9GZP7 353 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.69□□□□□ -1.02
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SPTAN1-228ENST00000635853 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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SPTAN1-228ENST00000635853 IL11RAQ14626 422 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 FDX2Q6P4F2 183 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC25A38Q96DW6 304 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 NUDT11Q96G61 164 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 CCL21O00585 134 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 FAHP16930 419 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 PLPPR5Q32ZL2 321 aa8.69□□□□□ -1.02
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SPTAN1-228ENST00000635853 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 TEX29Q8N6K0 151 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 FGF14Q92915 247 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.69□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC22A13Q9Y226 551 aa8.69□□□□□ -1.02
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