RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608220.5

LINC00343-210, long intergenic non-protein coding RNA 343, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00343, Length 806 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00343-210ENST00000608220 LHBP01229 141 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 GYPAP02724 150 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 RBP4P02753 201 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 HLA-DPB1P04440 258 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SMIM18P0DKX4 95 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 RPA2P15927 270 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 ZNF823P16415 610 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 CA6P23280 308 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SLC6A1P30531 599 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 KDELR2P33947 212 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 PMELP40967 661 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 GPR4P46093 362 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 OR3A1P47881 315 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 OR1E2P47887 323 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 TGM4P49221 684 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 BLVRAP53004 296 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SMIM11AP58511 58 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 DGCR6Q14129 220 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 MPPED2Q15777 294 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 RFX4Q33E94 735 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 CYBRD1Q53TN4 286 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 FAM201AQ5SY85 155 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 STUMQ69YW2 141 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 NANOGP8Q6NSW7 305 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SMARCD3Q6STE5 483 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 DPY19L4Q7Z388 723 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 Q8N2B8 174 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 FAM86B1Q8N7N1 296 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 THAP8Q8NA92 274 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SLC26A10Q8NG04 563 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 OR2T12Q8NG77 320 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 OR4X2Q8NGF9 303 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 OR52L1Q8NGH7 329 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 OR52H1Q8NGJ2 320 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 FANK1Q8TC84 345 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 RPS4Y2Q8TD47 263 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 LRRC29Q8WV35 223 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SLC7A6Q92536 515 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 TPD52L3Q96J77 140 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 B9D2Q9BPU9 175 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 BTBD10Q9BSF8 475 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 RTL8AQ9BWD3 113 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 VCX2Q9H322 139 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 RGCCQ9H4X1 137 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 RERGLQ9H628 205 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SLA2Q9H6Q3 261 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 Q9N2K0 584 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SIRT7Q9NRC8 400 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SIGLEC7Q9Y286 467 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 MPC1Q9Y5U8 109 aa3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 A0A087WUU8 490 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 A0A1W2PPK0 400 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 C3orf84H3BNL1 204 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 K7EQM0 130 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SLC1A7O00341 560 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 MRASO14807 208 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SLC22A2O15244 555 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SIGLEC5O15389 551 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 ANGPTL7O43827 346 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 H1F0P07305 194 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 RRASP10301 218 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 CLUP10909 449 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 GNB3P16520 340 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 HSD11B1P28845 292 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 GZMMP51124 257 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 DYNLT3P51808 116 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 CRYBA2P53672 197 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 IL18R1Q13478 541 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 SELPLGQ14242 412 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 RCN1Q15293 331 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 TAF13Q15543 124 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 ZFP69Q49AA0 526 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 GLYATL3Q5SZD4 288 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 AGBL2Q5U5Z8 902 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 WDR82Q6UXN9 313 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 CALHM1Q8IU99 346 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 STHQ8IWL8 128 aa3.11□□□□□ -1.91
LINC00343-210ENST00000608220 MICU2Q8IYU8 434 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.4 ms