RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608107.1

ITGB5-211, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-211ENST00000608107 ABHD1Q96SE0 405 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 AKAP9Q99996 3911 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 A0A0A6YYH2 397 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 ODAMA1E959 279 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 MEIOCA2RUB1 952 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 A6NJ64 397 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 B4DSR2 109 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 SCGNO76038 276 aa8.45□□□□□ -1.06
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ITGB5-211ENST00000608107 MSMBP08118 114 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 MELTFP08582 738 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
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ITGB5-211ENST00000608107 GLP1RP43220 463 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 KCNJ3P48549 501 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 ARFRP1Q13795 201 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 HACD4Q5VWC8 232 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa8.45□□□□□ -1.06
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ITGB5-211ENST00000608107 GAPTQ8N292 157 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 SMR3AQ99954 134 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 SOSTQ9BQB4 213 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 A0A1W2PQ09 198 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 SERPINE3A8MV23 424 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 H3BUI4 141 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 GPR37O15354 613 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 MMP23AO75900 390 aa8.44□□□□□ -1.06
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ITGB5-211ENST00000608107 FCGR3AP08637 254 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 CD3GP09693 182 aa8.44□□□□□ -1.06
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ITGB5-211ENST00000608107 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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ITGB5-211ENST00000608107 SETD6Q8TBK2 473 aa8.44□□□□□ -1.06
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ITGB5-211ENST00000608107 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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ITGB5-211ENST00000608107 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 DGCR2P98153 550 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 IL18Q14116 193 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF79Q15937 498 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 LTC4SQ16873 150 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB5-211ENST00000608107 UTF1Q5T230 341 aa8.43□□□□□ -1.06
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