RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 COX11Q9Y6N1 276 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 V9GYS6 101 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 hADV38S2A0JD32 116 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 FAM90A18PA6NE21 464 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ARRDC5A6NEK1 342 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 FAM90A16PA6NEW6 464 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SERPINE3A8MV23 424 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 FAM90A12PA8MX19 464 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 M0R129 80 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ATP8B1O43520 1251 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ENTPD6O75354 484 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CCNB2O95067 398 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TNFRSF6BO95407 300 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 IFNGP01579 166 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 IGHG2P01859 326 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 FAM90A15PP0C7V4 464 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 FAM90A13PP0C7W8 464 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 FAM90A14PP0C7W9 464 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 FAM90A24PP0C7X0 464 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 BCL3P20749 454 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 GABRR1P24046 479 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CD34P28906 385 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 BRS3P32247 399 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 MAGEA2P43356 314 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 GLIPR1P48060 266 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 BLVRAP53004 296 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 P2RX3P56373 397 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ESRRGP62508 458 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 AESQ08117 197 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 IL24Q13007 206 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 IL18R1Q13478 541 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 APOFQ13790 326 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 UBE2V2Q15819 145 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ODF4Q2M2E3 257 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF260Q3ZCT1 412 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CLVS2Q5SYC1 327 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 Q6ZSR3 168 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SLC25A26Q70HW3 274 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SSX6Q7RTT6 188 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CPOQ8IVL8 374 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 DRAM1Q8N682 238 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 OR10G2Q8NGC3 310 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 OR5M8Q8NGP6 311 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 GLMPQ8WWB7 406 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 STMN2Q93045 179 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 COQ2Q96H96 371 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CEP19Q96LK0 163 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 NSMCE2Q96MF7 247 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CDRT15Q96T59 188 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 HSPB9Q9BQS6 159 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 PKIBQ9C010 78 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CCDC134Q9H6E4 229 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 EFCAB1Q9HAE3 211 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 GNB4Q9HAV0 340 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ZFP57Q9NU63 452 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 BAIAP2Q9UQB8 552 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TNCP24821 2201 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 A0A087X0M5 115 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 A0A1B0GX30 115 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 A0A1W2PPE3 182 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 LEUTXA8MZ59 168 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 H3BN98 237 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 DLGAP1O14490 977 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms